More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0243 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
768 aa  1537    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  36.44 
 
 
1757 aa  267  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  43.75 
 
 
3977 aa  154  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  38.69 
 
 
2182 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  53.85 
 
 
1526 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  29.62 
 
 
615 aa  97.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  32.21 
 
 
574 aa  80.1  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  37.5 
 
 
1424 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  34.87 
 
 
593 aa  77  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  34.97 
 
 
361 aa  74.3  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  34.97 
 
 
361 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  26.04 
 
 
1543 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.4 
 
 
1180 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  26.04 
 
 
1821 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  32.47 
 
 
361 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  26.54 
 
 
484 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.65 
 
 
2775 aa  70.1  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 
851 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  25.28 
 
 
1584 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
946 aa  68.6  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  43.59 
 
 
2667 aa  68.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  43.18 
 
 
232 aa  67.4  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.42 
 
 
862 aa  66.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  36.28 
 
 
713 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  37.3 
 
 
3587 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  40.21 
 
 
713 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  31.71 
 
 
7149 aa  65.5  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.28 
 
 
1963 aa  65.5  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  39.25 
 
 
932 aa  64.7  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  45.21 
 
 
769 aa  64.7  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  36.73 
 
 
763 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  44.16 
 
 
4334 aa  64.3  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  44.74 
 
 
4723 aa  64.3  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  38.61 
 
 
928 aa  64.3  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  33.33 
 
 
3587 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  40.21 
 
 
1764 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  24.51 
 
 
785 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  27.62 
 
 
451 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  38.3 
 
 
744 aa  63.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
741 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  34.59 
 
 
421 aa  62.4  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  29.21 
 
 
1108 aa  62.4  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  50 
 
 
2105 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  44 
 
 
833 aa  62  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
734 aa  62  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50 
 
 
1795 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 
2336 aa  61.6  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.59 
 
 
3954 aa  61.2  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.48 
 
 
5839 aa  61.2  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  37.23 
 
 
998 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  37.23 
 
 
782 aa  60.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  47.95 
 
 
243 aa  60.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.78 
 
 
3427 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  45.95 
 
 
1236 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  43.9 
 
 
928 aa  60.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  43.48 
 
 
3094 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.51 
 
 
9867 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  32.79 
 
 
1805 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  31.54 
 
 
467 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  28.25 
 
 
485 aa  59.7  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.09 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.78 
 
 
2885 aa  59.7  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.87 
 
 
4798 aa  59.7  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
1175 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  48 
 
 
245 aa  58.9  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  27.93 
 
 
595 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.2 
 
 
2678 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  40.43 
 
 
518 aa  59.3  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  33.93 
 
 
781 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.61 
 
 
3619 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  42.86 
 
 
1499 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0533  hemolysin-type calcium-binding region  42.67 
 
 
359 aa  58.9  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.695548  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.61 
 
 
3619 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  40.54 
 
 
507 aa  58.5  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  41.84 
 
 
2954 aa  58.5  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35 
 
 
577 aa  58.5  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  47.22 
 
 
582 aa  58.5  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 
639 aa  58.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  46.67 
 
 
686 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.81 
 
 
2239 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  40.26 
 
 
795 aa  58.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  47.22 
 
 
585 aa  58.2  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  44.44 
 
 
679 aa  58.2  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  44.71 
 
 
1532 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  45.21 
 
 
1883 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  44.29 
 
 
1814 aa  57.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  27.54 
 
 
482 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  42.05 
 
 
2145 aa  58.2  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  30.73 
 
 
2245 aa  57.8  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  36.78 
 
 
2342 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  36.78 
 
 
2342 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.66 
 
 
5962 aa  57.4  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  30.32 
 
 
6662 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 
620 aa  57.4  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1816  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 
273 aa  57  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000360233  n/a   
 
 
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.23 
 
 
1279 aa  57.4  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.32 
 
 
6683 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  30.32 
 
 
6779 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  36.67 
 
 
219 aa  57  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  38.14 
 
 
1055 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>