95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0622 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  100 
 
 
1108 aa  2222    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  49.77 
 
 
1408 aa  328  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  48.64 
 
 
1410 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  48.64 
 
 
1410 aa  311  5.9999999999999995e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  47.94 
 
 
1422 aa  280  8e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  47.79 
 
 
1107 aa  255  4.0000000000000004e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  60.66 
 
 
467 aa  240  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  63.78 
 
 
580 aa  231  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  61.75 
 
 
464 aa  231  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  57.21 
 
 
502 aa  230  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  62.22 
 
 
485 aa  229  2e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  63.22 
 
 
363 aa  226  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  58.33 
 
 
700 aa  218  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  58.01 
 
 
613 aa  215  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  60.45 
 
 
595 aa  214  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  57.38 
 
 
451 aa  214  9e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  59.32 
 
 
595 aa  212  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  60.45 
 
 
559 aa  211  6e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  57.07 
 
 
621 aa  209  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  60.82 
 
 
564 aa  208  6e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  53.37 
 
 
1584 aa  202  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  54.24 
 
 
1543 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  54.24 
 
 
1821 aa  201  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  59.35 
 
 
193 aa  179  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  32.35 
 
 
576 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  32.8 
 
 
576 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  32.35 
 
 
576 aa  166  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  31.74 
 
 
526 aa  162  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  32.27 
 
 
533 aa  162  4e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  48.8 
 
 
392 aa  154  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  31.26 
 
 
524 aa  151  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  64.29 
 
 
104 aa  131  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  36.26 
 
 
393 aa  125  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  30.66 
 
 
1222 aa  119  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  29.68 
 
 
826 aa  118  7.999999999999999e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  34.44 
 
 
480 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  31.72 
 
 
480 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  33.21 
 
 
478 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  27.94 
 
 
501 aa  112  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  33.46 
 
 
478 aa  112  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  33.21 
 
 
478 aa  111  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  30.97 
 
 
480 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  33.21 
 
 
480 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  31.34 
 
 
480 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  29.54 
 
 
480 aa  109  3e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.17 
 
 
921 aa  98.2  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  62.03 
 
 
80 aa  97.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  35.98 
 
 
307 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  32.28 
 
 
624 aa  80.1  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  27.27 
 
 
714 aa  78.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  40.2 
 
 
524 aa  75.5  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  25.21 
 
 
628 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  59.65 
 
 
615 aa  71.6  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  26.25 
 
 
717 aa  70.5  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  37.93 
 
 
2178 aa  69.3  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  26.42 
 
 
743 aa  68.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1554  hypothetical protein  24.03 
 
 
618 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842848  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  29.89 
 
 
726 aa  67  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  34.23 
 
 
681 aa  67  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  31.33 
 
 
785 aa  66.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  27.47 
 
 
778 aa  66.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  39.13 
 
 
1037 aa  65.1  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  28.4 
 
 
363 aa  64.7  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.6 
 
 
862 aa  64.3  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  28.4 
 
 
363 aa  63.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  25.6 
 
 
776 aa  63.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  31.13 
 
 
1121 aa  62.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  27.36 
 
 
1129 aa  62.4  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  28.57 
 
 
593 aa  62.4  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  29.21 
 
 
768 aa  62  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  24.84 
 
 
807 aa  61.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  26.71 
 
 
784 aa  60.8  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  31.97 
 
 
484 aa  60.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  26.48 
 
 
443 aa  58.9  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.45 
 
 
469 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  27.02 
 
 
792 aa  56.6  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  27.45 
 
 
1848 aa  56.2  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  27.11 
 
 
461 aa  55.8  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.41 
 
 
818 aa  55.1  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.27 
 
 
1679 aa  53.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  38.82 
 
 
482 aa  52  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  35.29 
 
 
480 aa  51.6  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  23.67 
 
 
1187 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  28.28 
 
 
558 aa  50.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  24.42 
 
 
911 aa  49.3  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.41 
 
 
706 aa  48.5  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.52 
 
 
821 aa  48.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  30.36 
 
 
459 aa  47.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  25.14 
 
 
461 aa  47.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  32.46 
 
 
1880 aa  46.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  29.67 
 
 
458 aa  45.8  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.94 
 
 
1919 aa  46.2  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.02 
 
 
900 aa  45.4  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  22.54 
 
 
658 aa  45.4  0.006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  25.91 
 
 
597 aa  45.4  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>