29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1554 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1554  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1261    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842848  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  43.85 
 
 		 628 aa  500  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  25.78 
 
 		 1107 aa  92.4  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  29.09 
 
 		 826 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  26.29 
 
 		 1408 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  28.83 
 
 		 1422 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 1410 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  29.34 
 
 		 1410 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1108 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  22.28 
 
 		 526 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  22.55 
 
 		 524 aa  53.5  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  25.21 
 
 		 480 aa  52.8  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  24.79 
 
 		 478 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  23.77 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  24.38 
 
 		 478 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  21.95 
 
 		 576 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  25.16 
 
 		 576 aa  48.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  21.41 
 
 		 576 aa  48.5  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  23.62 
 
 		 501 aa  48.1  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  28.31 
 
 		 533 aa  48.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1638  hypothetical protein  32.99 
 
 		 861 aa  47  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1820  putative lipoprotein  38.75 
 
 		 699 aa  46.6  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0873981  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.6 
 
 		 658 aa  47  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0118989  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  25.1 
 
 		 480 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  29.1 
 
 		 618 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  25.1 
 
 		 480 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  22.7 
 
 		 480 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  26.09 
 
 		 480 aa  43.9  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0983  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  22.7 
 
 		 1147 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>