36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1389 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  100 
 
 
564 aa  1140    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  62.83 
 
 
502 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  67.82 
 
 
559 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  63.89 
 
 
595 aa  234  4.0000000000000004e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  51.43 
 
 
451 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  61.05 
 
 
464 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  62.78 
 
 
595 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  62.3 
 
 
485 aa  229  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  58.38 
 
 
467 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  61.33 
 
 
363 aa  223  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  60.22 
 
 
580 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  56.91 
 
 
613 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  60 
 
 
1584 aa  216  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  55.25 
 
 
700 aa  212  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  58.33 
 
 
1543 aa  209  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  58.33 
 
 
1821 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  60.82 
 
 
1108 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  53.09 
 
 
621 aa  193  6e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  46.55 
 
 
392 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  53.5 
 
 
193 aa  166  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  40.11 
 
 
393 aa  141  3.9999999999999997e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  58.59 
 
 
104 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  72.15 
 
 
80 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  42.57 
 
 
524 aa  79.7  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  49.33 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  33.53 
 
 
785 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  33.33 
 
 
681 aa  67.4  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.34 
 
 
862 aa  60.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  36.9 
 
 
2178 aa  56.2  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  31.25 
 
 
1121 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  34.65 
 
 
480 aa  54.3  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  40.23 
 
 
1037 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 
484 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 
482 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  26.17 
 
 
768 aa  50.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  35.23 
 
 
458 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>