43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0741 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  953    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  68.25 
 
 
595 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  68.47 
 
 
595 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  67.57 
 
 
502 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  71.96 
 
 
580 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  66.67 
 
 
363 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  65.03 
 
 
485 aa  249  7e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  65.75 
 
 
464 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  65.14 
 
 
559 aa  240  4e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  60.66 
 
 
1108 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  58.38 
 
 
564 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  57 
 
 
621 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  56.28 
 
 
451 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  54.7 
 
 
700 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  44.49 
 
 
1584 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  44.63 
 
 
1821 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  53.3 
 
 
613 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  49.49 
 
 
1543 aa  192  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  55.23 
 
 
193 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  31.65 
 
 
393 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  78.22 
 
 
104 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  38.7 
 
 
392 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  75.95 
 
 
80 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  45.1 
 
 
524 aa  87  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  57.14 
 
 
615 aa  84  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  28.33 
 
 
785 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  36.94 
 
 
681 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.8 
 
 
862 aa  67.4  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  38.71 
 
 
2178 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  31.54 
 
 
768 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  38.14 
 
 
1037 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
484 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  28.3 
 
 
1121 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  32.61 
 
 
458 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  26.44 
 
 
421 aa  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  31.96 
 
 
459 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  31 
 
 
480 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  34.69 
 
 
373 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.77 
 
 
2911 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  35.79 
 
 
1133 aa  47  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  30.39 
 
 
362 aa  44.7  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.24 
 
 
1269 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.24 
 
 
1269 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>