More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0745 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 615 aa  1234    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  56.38 
 
 		 1037 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  53.76 
 
 		 2178 aa  214  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  33.63 
 
 		 458 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  34.24 
 
 		 595 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  33.98 
 
 		 595 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  34.1 
 
 		 459 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  29.62 
 
 		 768 aa  98.6  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1424 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 862 aa  86.3  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  30.61 
 
 		 580 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  57.14 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1821 aa  84  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1543 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  29.1 
 
 		 1584 aa  83.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.09 
 
 		 3427 aa  81.6  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  36.36 
 
 		 3587 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  39.58 
 
 		 833 aa  81.3  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.49 
 
 		 2667 aa  80.5  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  43.12 
 
 		 1306 aa  78.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.65 
 
 		 1016 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  49.33 
 
 		 564 aa  77.4  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  46.23 
 
 		 950 aa  77.8  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  43.52 
 
 		 998 aa  77.4  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  47.3 
 
 		 613 aa  77.4  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.85 
 
 		 1236 aa  77.4  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  34.17 
 
 		 574 aa  77  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  51.32 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  38.85 
 
 		 2885 aa  75.5  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.31 
 
 		 2678 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  52.17 
 
 		 80 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  39.42 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  38.76 
 
 		 1526 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.57 
 
 		 5098 aa  74.7  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  57.58 
 
 		 1532 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  50 
 
 		 485 aa  74.3  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1974  peptidase-like  49.37 
 
 		 1594 aa  74.3  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.195376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  54.43 
 
 		 938 aa  73.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  35.66 
 
 		 3587 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  49.33 
 
 		 464 aa  73.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  44.79 
 
 		 729 aa  73.2  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.16 
 
 		 1164 aa  72.4  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  46.58 
 
 		 700 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  50.67 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  47.27 
 
 		 946 aa  72.8  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  40.71 
 
 		 2182 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.52 
 
 		 1963 aa  72.4  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.2 
 
 		 1553 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 1534 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  32.28 
 
 		 2537 aa  72  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5021  RTX toxins and related Ca2+-binding protein- like protein  36.84 
 
 		 717 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.63904  normal  0.0614603 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  26.52 
 
 		 482 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  42.45 
 
 		 572 aa  72  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  31.14 
 
 		 652 aa  72.4  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  59.65 
 
 		 1108 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  47.95 
 
 		 621 aa  71.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  42.86 
 
 		 1625 aa  71.2  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  51.28 
 
 		 588 aa  71.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  48.57 
 
 		 363 aa  70.9  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  30.9 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  50.59 
 
 		 742 aa  70.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.59 
 
 		 2954 aa  70.9  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  40.19 
 
 		 959 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  34.93 
 
 		 782 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  50.67 
 
 		 1499 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  33.01 
 
 		 2296 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  42.39 
 
 		 2329 aa  69.7  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  39.72 
 
 		 1538 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  36.27 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  38.66 
 
 		 5094 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  45.78 
 
 		 757 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 2336 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  52.86 
 
 		 942 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  38.95 
 
 		 1383 aa  70.1  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  36.24 
 
 		 2950 aa  70.5  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.04 
 
 		 795 aa  70.1  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  40.19 
 
 		 860 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  43.12 
 
 		 982 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  52.05 
 
 		 760 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  46.75 
 
 		 3598 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.18 
 
 		 1795 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  37.5 
 
 		 4798 aa  69.7  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.2 
 
 		 2105 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  48 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  38.13 
 
 		 680 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  47.5 
 
 		 813 aa  69.3  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  48 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  40.91 
 
 		 980 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  48.68 
 
 		 1287 aa  68.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  43.42 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.05 
 
 		 1372 aa  68.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  42.52 
 
 		 2775 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  45.68 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.32 
 
 		 2346 aa  67.8  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  30.36 
 
 		 3619 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  44.12 
 
 		 688 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  50.65 
 
 		 4334 aa  67.8  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  54.41 
 
 		 1156 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  30.36 
 
 		 3619 aa  67.4  0.0000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>