More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3983 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  100 
 
 		 785 aa  1575    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  41.71 
 
 		 820 aa  248  3e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  43.15 
 
 		 531 aa  236  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  43.15 
 
 		 531 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  42.01 
 
 		 614 aa  232  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  44.21 
 
 		 1631 aa  224  6e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  36.72 
 
 		 451 aa  201  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  39.93 
 
 		 504 aa  181  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  40.54 
 
 		 481 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  37.27 
 
 		 474 aa  169  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  39.58 
 
 		 478 aa  169  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  38.26 
 
 		 476 aa  169  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  37.66 
 
 		 479 aa  165  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  37.91 
 
 		 475 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  36.93 
 
 		 476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  38.49 
 
 		 486 aa  164  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  36.77 
 
 		 490 aa  162  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  34.79 
 
 		 727 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  36.82 
 
 		 480 aa  162  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  38.64 
 
 		 479 aa  160  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  35.37 
 
 		 444 aa  142  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  36.65 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  35.37 
 
 		 442 aa  141  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  35.25 
 
 		 444 aa  139  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  34.9 
 
 		 648 aa  134  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  35.44 
 
 		 1134 aa  124  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  34.23 
 
 		 745 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  35.13 
 
 		 713 aa  121  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  34.49 
 
 		 713 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  40.91 
 
 		 606 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  32.99 
 
 		 1133 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  30.91 
 
 		 1112 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  34.98 
 
 		 513 aa  102  4e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.56 
 
 		 1112 aa  100  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  33.86 
 
 		 486 aa  97.4  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  37.91 
 
 		 535 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  30.54 
 
 		 641 aa  87.8  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  29.84 
 
 		 484 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  33.18 
 
 		 656 aa  80.9  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  34.47 
 
 		 535 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  27.3 
 
 		 595 aa  79.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1821 aa  78.2  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  38.79 
 
 		 763 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  27.94 
 
 		 1543 aa  77  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  32.17 
 
 		 613 aa  77.4  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  31.1 
 
 		 861 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  25.9 
 
 		 1584 aa  75.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  44.66 
 
 		 524 aa  75.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  28.33 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  38.66 
 
 		 781 aa  75.5  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 		 862 aa  73.9  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  38.66 
 
 		 782 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  32.67 
 
 		 700 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  33.53 
 
 		 564 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  33.11 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  26.77 
 
 		 595 aa  73.2  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  25.85 
 
 		 681 aa  71.2  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  33.56 
 
 		 464 aa  70.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  29.2 
 
 		 482 aa  70.5  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  33.56 
 
 		 485 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  34.13 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  26.92 
 
 		 580 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  32.89 
 
 		 502 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  32.39 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  38.03 
 
 		 1037 aa  68.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  26.59 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.93 
 
 		 1180 aa  68.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  39.77 
 
 		 2950 aa  67.8  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1108 aa  66.2  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  49 
 
 		 1213 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  30.2 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  32.21 
 
 		 621 aa  65.5  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.12 
 
 		 2775 aa  65.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42 
 
 		 1424 aa  64.3  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  40.98 
 
 		 1582 aa  63.9  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  30.43 
 
 		 421 aa  63.9  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  24.51 
 
 		 768 aa  63.5  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  43.43 
 
 		 932 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  60.38 
 
 		 928 aa  62.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.84 
 
 		 928 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  48.75 
 
 		 833 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  39.8 
 
 		 2182 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  50.79 
 
 		 1286 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  32.89 
 
 		 1499 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  38.02 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  46.51 
 
 		 4106 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  36.67 
 
 		 2743 aa  58.5  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  62 
 
 		 1699 aa  58.5  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 361 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  64 
 
 		 1166 aa  58.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  36.43 
 
 		 1764 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  31.79 
 
 		 1757 aa  57.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.51 
 
 		 1963 aa  58.2  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  40.4 
 
 		 928 aa  57.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 865 aa  57.8  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  50.79 
 
 		 1712 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 		 539 aa  57.4  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  40.62 
 
 		 946 aa  57.4  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  58.49 
 
 		 1390 aa  57.4  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>