More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5278 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  75.72 
 
 		 1112 aa  1633    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  100 
 
 		 1112 aa  2176    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  37.64 
 
 		 2911 aa  218  5.9999999999999996e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.63 
 
 		 1415 aa  187  7e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  29.96 
 
 		 1134 aa  185  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  36.26 
 
 		 1544 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33.49 
 
 		 1079 aa  180  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.77 
 
 		 1133 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.63 
 
 		 4800 aa  164  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  38.22 
 
 		 745 aa  159  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.84 
 
 		 2836 aa  157  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32.95 
 
 		 1884 aa  150  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.62 
 
 		 833 aa  143  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  32.03 
 
 		 1582 aa  142  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  32.7 
 
 		 2807 aa  141  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  31.25 
 
 		 1286 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.23 
 
 		 2678 aa  139  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  30.75 
 
 		 727 aa  137  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.6 
 
 		 1390 aa  136  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  47.96 
 
 		 2097 aa  135  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  28.57 
 
 		 764 aa  135  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.82 
 
 		 1145 aa  131  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.45 
 
 		 2954 aa  131  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  30.85 
 
 		 556 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  46.08 
 
 		 759 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  33.14 
 
 		 1072 aa  128  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 		 795 aa  125  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  35.55 
 
 		 3619 aa  125  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  35.1 
 
 		 2950 aa  125  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  35.26 
 
 		 3619 aa  124  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  34.07 
 
 		 4334 aa  123  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  30.51 
 
 		 3954 aa  124  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  32.21 
 
 		 1855 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  50.72 
 
 		 574 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.54 
 
 		 1279 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  29.58 
 
 		 2467 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.11 
 
 		 3209 aa  121  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  32.53 
 
 		 531 aa  121  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  32.53 
 
 		 531 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  30.52 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  34.27 
 
 		 769 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  29.54 
 
 		 1164 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  42.92 
 
 		 4687 aa  119  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  32.01 
 
 		 2133 aa  119  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  33.08 
 
 		 1213 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.23 
 
 		 3608 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  29.61 
 
 		 614 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.16 
 
 		 1532 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  36.49 
 
 		 648 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.76 
 
 		 1795 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  33.4 
 
 		 2775 aa  116  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 		 1534 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  35.04 
 
 		 1400 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.68 
 
 		 1363 aa  114  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 1628 aa  112  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.72 
 
 		 1424 aa  112  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.85 
 
 		 535 aa  111  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  33.13 
 
 		 490 aa  112  6e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  30.64 
 
 		 480 aa  110  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  30.56 
 
 		 595 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  40.18 
 
 		 534 aa  109  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  34.31 
 
 		 3026 aa  109  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.52 
 
 		 824 aa  108  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  34.21 
 
 		 946 aa  107  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  27.41 
 
 		 1499 aa  107  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  28.03 
 
 		 1864 aa  106  2e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.82 
 
 		 833 aa  106  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  31.71 
 
 		 1631 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  29.59 
 
 		 486 aa  104  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  35.96 
 
 		 2105 aa  104  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  30.03 
 
 		 474 aa  102  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  30.6 
 
 		 965 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  31.29 
 
 		 476 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  34.3 
 
 		 504 aa  101  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  44.12 
 
 		 462 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  34.38 
 
 		 479 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.55 
 
 		 1156 aa  100  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  31.85 
 
 		 475 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  30.56 
 
 		 785 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  32.08 
 
 		 476 aa  100  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  32.3 
 
 		 442 aa  99.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  32.3 
 
 		 444 aa  99.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.11 
 
 		 3427 aa  99  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  32.64 
 
 		 479 aa  99  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  28.39 
 
 		 1764 aa  98.2  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.21 
 
 		 1895 aa  97.8  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  29.65 
 
 		 481 aa  98.2  9e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  32.29 
 
 		 2198 aa  97.8  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.75 
 
 		 1197 aa  97.8  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.28 
 
 		 2667 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  31.06 
 
 		 820 aa  97.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  28.81 
 
 		 478 aa  96.3  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.17 
 
 		 1883 aa  95.9  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.14 
 
 		 2689 aa  95.1  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  33.72 
 
 		 589 aa  95.5  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  31.69 
 
 		 444 aa  95.5  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  29 
 
 		 860 aa  94.7  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.43 
 
 		 1236 aa  94.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  47.79 
 
 		 448 aa  94  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  30.81 
 
 		 1287 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>