More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2500 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  75.76 
 
 		 448 aa  687    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  934    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  29.27 
 
 		 485 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  29.54 
 
 		 323 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  47.83 
 
 		 1029 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  47.83 
 
 		 1029 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  41.72 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  44.12 
 
 		 1112 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.56 
 
 		 2346 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  40.38 
 
 		 574 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  27.38 
 
 		 302 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  48.65 
 
 		 1112 aa  89.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  36.18 
 
 		 621 aa  89.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  26.38 
 
 		 392 aa  87.4  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  29.75 
 
 		 286 aa  87.4  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  35.5 
 
 		 614 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  37.43 
 
 		 1055 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  29.2 
 
 		 369 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  41.1 
 
 		 565 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.01 
 
 		 1415 aa  85.5  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  28.83 
 
 		 368 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  39.39 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.84 
 
 		 2678 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  37.57 
 
 		 1019 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  44.53 
 
 		 531 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  37.44 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  37.44 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  38.1 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.33 
 
 		 588 aa  76.6  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  46.09 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  38.31 
 
 		 556 aa  75.9  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  38.26 
 
 		 547 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  37.41 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  36.61 
 
 		 813 aa  72.8  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  51.28 
 
 		 303 aa  72.4  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  45.63 
 
 		 1502 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  25.21 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.72 
 
 		 1180 aa  70.9  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 1022 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  33.94 
 
 		 1017 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 652 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  32.93 
 
 		 709 aa  69.3  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  26.11 
 
 		 299 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  36.54 
 
 		 1403 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  35.44 
 
 		 553 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  49.38 
 
 		 5171 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  46.32 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  45.45 
 
 		 421 aa  68.2  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  50.6 
 
 		 745 aa  68.2  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  36.77 
 
 		 1072 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  47.25 
 
 		 1202 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.59 
 
 		 3209 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  48.81 
 
 		 202 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  48.81 
 
 		 202 aa  67  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4127  hemolysin-type calcium-binding region  46.32 
 
 		 475 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  52 
 
 		 475 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  51.35 
 
 		 5218 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  41.27 
 
 		 475 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  35.22 
 
 		 901 aa  66.6  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  41.27 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  53.42 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  48.91 
 
 		 260 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  38.36 
 
 		 889 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  55 
 
 		 1079 aa  66.2  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.5 
 
 		 2239 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  49.35 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  53.42 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.06 
 
 		 547 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  47.5 
 
 		 6779 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  42.42 
 
 		 5769 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  46.75 
 
 		 1699 aa  65.5  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  41.49 
 
 		 820 aa  65.9  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.5 
 
 		 6683 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  37.5 
 
 		 2567 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  47.5 
 
 		 6662 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  47.19 
 
 		 709 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  43.3 
 
 		 1839 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  25.46 
 
 		 357 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43897  predicted protein  42.53 
 
 		 2125 aa  64.3  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.32 
 
 		 5962 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2577  lipolytic protein G-D-S-L family  30.13 
 
 		 681 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  40.62 
 
 		 1037 aa  64.7  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  39.2 
 
 		 4285 aa  64.7  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  36.42 
 
 		 856 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 		 2537 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  43 
 
 		 1544 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  32.37 
 
 		 917 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  48.61 
 
 		 6753 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  51.28 
 
 		 946 aa  63.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  34.07 
 
 		 515 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  47.3 
 
 		 1394 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.09 
 
 		 1164 aa  63.5  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  55.17 
 
 		 1582 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  35.66 
 
 		 1168 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  49.35 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  39.1 
 
 		 2097 aa  63.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  48.75 
 
 		 221 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  38.55 
 
 		 1175 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  42.86 
 
 		 4791 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33710  Secreted mannuronan C5-epimerase  33.52 
 
 		 998 aa  63.2  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>