27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0991 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
286 aa  563  1e-160  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
323 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  32.39 
 
 
392 aa  152  5.9999999999999996e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  34.93 
 
 
485 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  28.52 
 
 
448 aa  92.8  6e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  29.05 
 
 
462 aa  87.4  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  27.18 
 
 
322 aa  86.3  6e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  29.49 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1000  TM1410 hypothetical-related protein  49.41 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  27.48 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  27.03 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  22.54 
 
 
299 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  23.2 
 
 
918 aa  55.1  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  23.08 
 
 
262 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  25.95 
 
 
980 aa  49.3  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  27.81 
 
 
908 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  28.35 
 
 
953 aa  45.8  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  24.82 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2649  extracellular endo alpha-1 4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase-like  32.05 
 
 
374 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  27.1 
 
 
961 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  22.16 
 
 
395 aa  43.9  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  23.28 
 
 
314 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  25.36 
 
 
357 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  24.68 
 
 
282 aa  43.5  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  23.22 
 
 
412 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  25.44 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  25.71 
 
 
917 aa  42.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>