30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1420 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
323 aa  655    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
392 aa  213  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
286 aa  169  6e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  33.74 
 
 
485 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  31.65 
 
 
322 aa  125  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  28.42 
 
 
448 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  29.28 
 
 
302 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  29.12 
 
 
462 aa  112  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1000  TM1410 hypothetical-related protein  43.53 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  29.75 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  29.56 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  22.33 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  28.48 
 
 
357 aa  65.9  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  28.68 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  23.36 
 
 
262 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  23.58 
 
 
314 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  25.88 
 
 
917 aa  57.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2649  extracellular endo alpha-1 4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase-like  31.71 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  22.39 
 
 
918 aa  54.3  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  23.96 
 
 
908 aa  51.2  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  23.5 
 
 
412 aa  49.3  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  25 
 
 
1002 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  23.71 
 
 
395 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  24.18 
 
 
939 aa  47  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  29.37 
 
 
980 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  23.64 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  20.15 
 
 
933 aa  43.5  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  23.11 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  26.71 
 
 
953 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  24.29 
 
 
231 aa  42.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>