44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3207 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  42.92 
 
 		 941 aa  707    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  46.26 
 
 		 980 aa  775    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  40.8 
 
 		 961 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  42.94 
 
 		 922 aa  657    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  40.92 
 
 		 942 aa  671    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  100 
 
 		 918 aa  1877    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  43.67 
 
 		 943 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  41.38 
 
 		 953 aa  674    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  46.4 
 
 		 948 aa  747    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  52.46 
 
 		 917 aa  958    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  38.04 
 
 		 939 aa  608  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  40 
 
 		 970 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  37.5 
 
 		 908 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  38.8 
 
 		 923 aa  557  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  38.63 
 
 		 948 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  39.04 
 
 		 933 aa  550  1e-155  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  36.87 
 
 		 948 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  36.78 
 
 		 925 aa  511  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  36.48 
 
 		 919 aa  505  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  34.66 
 
 		 985 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  34.55 
 
 		 917 aa  453  1.0000000000000001e-126  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  34.69 
 
 		 1002 aa  412  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  49.46 
 
 		 305 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  43.43 
 
 		 321 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  40.49 
 
 		 262 aa  184  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  37.61 
 
 		 795 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  27.33 
 
 		 764 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  29.25 
 
 		 286 aa  104  7e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  25.18 
 
 		 282 aa  92.4  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  25.19 
 
 		 518 aa  89.4  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  25.9 
 
 		 258 aa  80.9  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  27.64 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  26.44 
 
 		 253 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  25.25 
 
 		 322 aa  59.3  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  27.78 
 
 		 231 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  25.76 
 
 		 448 aa  56.6  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  23.2 
 
 		 286 aa  55.1  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  21.8 
 
 		 273 aa  54.7  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  20.98 
 
 		 323 aa  54.7  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  23.64 
 
 		 272 aa  48.9  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  22.47 
 
 		 462 aa  48.9  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  20.63 
 
 		 395 aa  46.2  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  21.76 
 
 		 485 aa  45.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  23.03 
 
 		 272 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>