24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2975 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  100 
 
 		 795 aa  1651    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  29.45 
 
 		 908 aa  238  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  28.27 
 
 		 943 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  26.81 
 
 		 961 aa  221  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  27.51 
 
 		 764 aa  219  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  28.2 
 
 		 941 aa  215  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  29.05 
 
 		 985 aa  213  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  25.91 
 
 		 948 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  25.82 
 
 		 923 aa  207  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  26.75 
 
 		 970 aa  207  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  25.73 
 
 		 933 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  26.47 
 
 		 917 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  39.86 
 
 		 980 aa  181  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  36.69 
 
 		 948 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  39.41 
 
 		 953 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  38.29 
 
 		 925 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  35.31 
 
 		 942 aa  156  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  37.17 
 
 		 919 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  37.61 
 
 		 918 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  36.2 
 
 		 917 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  36.28 
 
 		 922 aa  126  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  30.66 
 
 		 948 aa  127  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  32.29 
 
 		 939 aa  126  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1002 aa  55.5  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>