41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2432 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  100 
 
 
939 aa  1936    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  39.09 
 
 
941 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  38.37 
 
 
942 aa  631  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  38.34 
 
 
943 aa  616  1e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  37.46 
 
 
948 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  38.31 
 
 
918 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  36.51 
 
 
980 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  35.67 
 
 
953 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  36.8 
 
 
917 aa  572  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  36.08 
 
 
948 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  36.56 
 
 
933 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  35.61 
 
 
961 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  35.67 
 
 
922 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  34.57 
 
 
908 aa  526  1e-148  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  33.06 
 
 
925 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  31.93 
 
 
919 aa  439  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  31.05 
 
 
923 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  32.08 
 
 
917 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  30.38 
 
 
970 aa  421  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  32.77 
 
 
1002 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  29.89 
 
 
948 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  52.85 
 
 
262 aa  266  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  29.77 
 
 
985 aa  254  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  39.21 
 
 
321 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  39.56 
 
 
305 aa  201  6e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  24.57 
 
 
764 aa  127  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  32.29 
 
 
795 aa  126  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  26.64 
 
 
286 aa  106  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  26.02 
 
 
282 aa  95.5  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  30.37 
 
 
518 aa  81.3  0.00000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  26.52 
 
 
322 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  23.79 
 
 
258 aa  57  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  23.14 
 
 
253 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  26.4 
 
 
231 aa  53.9  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  24.5 
 
 
262 aa  52.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  23.61 
 
 
448 aa  51.6  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  25.14 
 
 
391 aa  48.5  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  21.92 
 
 
392 aa  48.1  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  25.13 
 
 
485 aa  47.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  24.18 
 
 
323 aa  47  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  27.38 
 
 
272 aa  45.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>