37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1499 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  621  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  60.63 
 
 		 961 aa  363  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  63.7 
 
 		 953 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  62.5 
 
 		 980 aa  352  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  66.02 
 
 		 948 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  55.73 
 
 		 321 aa  319  3e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  55.92 
 
 		 941 aa  275  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  54.37 
 
 		 942 aa  274  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  51.12 
 
 		 943 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  52.21 
 
 		 918 aa  258  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  51.54 
 
 		 922 aa  240  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  47.98 
 
 		 917 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  41.7 
 
 		 939 aa  210  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  41.06 
 
 		 262 aa  192  7e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  35.34 
 
 		 1002 aa  175  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  36.21 
 
 		 908 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  40.64 
 
 		 948 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  40.4 
 
 		 933 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  34.38 
 
 		 917 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  36.51 
 
 		 923 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  34.66 
 
 		 970 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  32.58 
 
 		 948 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  27.37 
 
 		 282 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  31.79 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  32.22 
 
 		 925 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  32.22 
 
 		 919 aa  97.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  31.27 
 
 		 985 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  22.98 
 
 		 518 aa  67.8  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  25.11 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  27.16 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  28.79 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  26.29 
 
 		 231 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  30.83 
 
 		 448 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  23.64 
 
 		 323 aa  43.9  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  24.64 
 
 		 253 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  26.67 
 
 		 286 aa  42.7  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  28.33 
 
 		 462 aa  42.4  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>