28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3413 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  71.05 
 
 		 985 aa  1354    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  96.76 
 
 		 919 aa  1790    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  100 
 
 		 925 aa  1875    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  48.39 
 
 		 980 aa  881    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  45.96 
 
 		 970 aa  762    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  42.07 
 
 		 961 aa  674    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  44.69 
 
 		 948 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  50.22 
 
 		 948 aa  876    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  44.53 
 
 		 923 aa  744    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  47.54 
 
 		 953 aa  800    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  41.08 
 
 		 941 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  39.62 
 
 		 943 aa  611  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  40.25 
 
 		 942 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  37.05 
 
 		 917 aa  551  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  36.98 
 
 		 922 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  37.12 
 
 		 918 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  34.9 
 
 		 948 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  34.77 
 
 		 933 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  33.29 
 
 		 939 aa  446  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  31.21 
 
 		 908 aa  413  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  31.31 
 
 		 917 aa  344  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  25.49 
 
 		 1002 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  38.29 
 
 		 795 aa  157  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  26.15 
 
 		 764 aa  118  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  30.04 
 
 		 321 aa  105  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  34.07 
 
 		 305 aa  93.2  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  29.37 
 
 		 262 aa  76.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  28.82 
 
 		 286 aa  50.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>