40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1621 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  100 
 
 		 286 aa  567  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  38.58 
 
 		 282 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  31.35 
 
 		 980 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  33.21 
 
 		 922 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  26.64 
 
 		 939 aa  106  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  31.82 
 
 		 943 aa  106  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  32.93 
 
 		 948 aa  106  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  32.35 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  29.96 
 
 		 941 aa  105  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  32.25 
 
 		 961 aa  102  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  29.52 
 
 		 918 aa  100  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  30 
 
 		 953 aa  99.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  30.16 
 
 		 321 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  28.8 
 
 		 942 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  27.35 
 
 		 917 aa  93.2  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  31.79 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  25.88 
 
 		 908 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  26.47 
 
 		 518 aa  85.9  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  32.7 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  27.52 
 
 		 917 aa  75.9  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  25.73 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  27.66 
 
 		 948 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  28.33 
 
 		 933 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  24.8 
 
 		 1002 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  27.14 
 
 		 395 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  30.23 
 
 		 231 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  25.86 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  29.32 
 
 		 985 aa  57  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  25.28 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  34.25 
 
 		 462 aa  56.6  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  33.56 
 
 		 448 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  21.05 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  21.88 
 
 		 272 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  28.89 
 
 		 314 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  24.83 
 
 		 392 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  22.22 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  23.08 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  28.24 
 
 		 925 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  28.24 
 
 		 919 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  22.46 
 
 		 369 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>