18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2968 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  796    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  73.1 
 
 		 391 aa  524  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  46.88 
 
 		 412 aa  272  8.000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  46.67 
 
 		 314 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  27.14 
 
 		 286 aa  64.3  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  27.21 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  24.49 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  27.03 
 
 		 273 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  22.84 
 
 		 272 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  22.49 
 
 		 518 aa  49.7  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  21.83 
 
 		 272 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  20.3 
 
 		 918 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  23.33 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  24.52 
 
 		 262 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  21.99 
 
 		 286 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  26.59 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  21 
 
 		 302 aa  43.1  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>