27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1609 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  556  1e-157  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  40.56 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  24.19 
 
 		 908 aa  62  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  28.99 
 
 		 314 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  36.52 
 
 		 412 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  23.08 
 
 		 918 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  34.31 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  31.52 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  23.37 
 
 		 917 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2968  hypothetical protein  26.74 
 
 		 395 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02953  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G07890)  24.5 
 
 		 314 aa  49.7  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  20.85 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2531  TM1410 hypothetical-related protein  28.3 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0125598  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  32.74 
 
 		 391 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  24.19 
 
 		 336 aa  48.1  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  21.63 
 
 		 933 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  24.12 
 
 		 282 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4700  TM1410 hypothetical-related protein  26.67 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.267519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  22.67 
 
 		 518 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  23.68 
 
 		 943 aa  45.8  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  20.77 
 
 		 948 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  27.04 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  24.32 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  29.8 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3224  hypothetical protein  26 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  20.9 
 
 		 357 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  23.37 
 
 		 262 aa  42.4  0.009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>