37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2073 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  100 
 
 		 933 aa  1872    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  95 
 
 		 948 aa  1744    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  37.92 
 
 		 942 aa  595  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  38.74 
 
 		 941 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  38.24 
 
 		 943 aa  571  1e-161  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  36.62 
 
 		 939 aa  566  1e-160  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  38.65 
 
 		 953 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  36.94 
 
 		 980 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  39.11 
 
 		 918 aa  550  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  38.86 
 
 		 948 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  36.16 
 
 		 961 aa  503  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  34.09 
 
 		 917 aa  490  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  35.46 
 
 		 917 aa  477  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  30.6 
 
 		 908 aa  476  1e-133  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  37.64 
 
 		 922 aa  456  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  34.59 
 
 		 925 aa  444  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  33.83 
 
 		 970 aa  445  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  34.21 
 
 		 919 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  34.39 
 
 		 923 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  32.57 
 
 		 948 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  33.16 
 
 		 985 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  31.63 
 
 		 1002 aa  376  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  25.73 
 
 		 795 aa  187  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  38.55 
 
 		 262 aa  164  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  39.64 
 
 		 305 aa  158  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  35.34 
 
 		 321 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  25.96 
 
 		 764 aa  112  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  32.08 
 
 		 231 aa  98.2  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  30.94 
 
 		 253 aa  93.2  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  27.6 
 
 		 282 aa  87.8  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  29.18 
 
 		 322 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  25.35 
 
 		 518 aa  80.1  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  28.52 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  33.54 
 
 		 262 aa  59.3  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  21.63 
 
 		 273 aa  47  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  25.7 
 
 		 368 aa  45.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  23.1 
 
 		 392 aa  44.3  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>