35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1904 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  100 
 
 
917 aa  1867    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  37.24 
 
 
943 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  35.91 
 
 
942 aa  498  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  35.5 
 
 
941 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  33.33 
 
 
908 aa  473  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  35.51 
 
 
933 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  34.94 
 
 
948 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  35.03 
 
 
918 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  34.06 
 
 
948 aa  449  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  33.86 
 
 
917 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  32.08 
 
 
939 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  32.65 
 
 
980 aa  421  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  32.66 
 
 
961 aa  422  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  33.11 
 
 
953 aa  412  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  32.18 
 
 
922 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  29.5 
 
 
1002 aa  341  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  31.2 
 
 
925 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  30.87 
 
 
919 aa  334  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  28.82 
 
 
970 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  29.44 
 
 
923 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  30.95 
 
 
985 aa  301  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  28.62 
 
 
948 aa  287  5.999999999999999e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  33.73 
 
 
321 aa  138  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  36.2 
 
 
795 aa  135  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  34.38 
 
 
305 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  30.2 
 
 
262 aa  103  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  28.49 
 
 
518 aa  85.1  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  27.52 
 
 
286 aa  75.9  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  23.32 
 
 
764 aa  74.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  25.36 
 
 
282 aa  70.9  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  30.61 
 
 
231 aa  65.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  28.16 
 
 
272 aa  58.9  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  27.59 
 
 
272 aa  58.2  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  29.56 
 
 
262 aa  53.5  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  26.63 
 
 
412 aa  45.8  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>