35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1043 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  43.37 
 
 		 917 aa  730    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  42.91 
 
 		 918 aa  711    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  38.81 
 
 		 939 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  46.85 
 
 		 953 aa  780    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  45.14 
 
 		 980 aa  791    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  42.69 
 
 		 961 aa  722    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  44.16 
 
 		 922 aa  714    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  100 
 
 		 941 aa  1917    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  56.13 
 
 		 942 aa  1068    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  64.5 
 
 		 943 aa  1189    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  45.76 
 
 		 948 aa  778    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  40.87 
 
 		 925 aa  629  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  40.82 
 
 		 919 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  38.92 
 
 		 970 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  39.18 
 
 		 923 aa  595  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  38.79 
 
 		 933 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  38.82 
 
 		 948 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  37.97 
 
 		 948 aa  568  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  34.45 
 
 		 908 aa  538  1e-151  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  35.4 
 
 		 917 aa  487  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1002 aa  365  2e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  35.43 
 
 		 985 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  52.92 
 
 		 305 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  48.82 
 
 		 321 aa  253  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  28.2 
 
 		 795 aa  215  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  42.04 
 
 		 262 aa  199  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  27.39 
 
 		 764 aa  158  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  30 
 
 		 286 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  25.81 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  25 
 
 		 282 aa  80.5  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  27.4 
 
 		 262 aa  63.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  29.63 
 
 		 231 aa  59.3  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  28.46 
 
 		 258 aa  57.8  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  25.48 
 
 		 322 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  23.42 
 
 		 253 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>