34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2974 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  583  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  38.58 
 
 		 286 aa  193  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  29.32 
 
 		 961 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  27.13 
 
 		 917 aa  99.4  7e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  26.02 
 
 		 939 aa  95.5  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  30.26 
 
 		 922 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  27.24 
 
 		 305 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  28.22 
 
 		 943 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  25 
 
 		 918 aa  89.4  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  27.6 
 
 		 933 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  27.6 
 
 		 948 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  24.47 
 
 		 942 aa  80.9  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  24.4 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  24.37 
 
 		 980 aa  79.7  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  28.24 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  24.69 
 
 		 941 aa  79  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  26.46 
 
 		 953 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  23.36 
 
 		 908 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  26.24 
 
 		 948 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  25.36 
 
 		 917 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  22.33 
 
 		 323 aa  70.5  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  24.1 
 
 		 262 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  23.79 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  21.21 
 
 		 1002 aa  58.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 		 392 aa  52.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  23.28 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  29.03 
 
 		 448 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  30.4 
 
 		 462 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  21.19 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  24.12 
 
 		 273 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  24.02 
 
 		 357 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  23.31 
 
 		 985 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 286 aa  43.5  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  25 
 
 		 231 aa  43.5  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>