28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1836 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  467  1.0000000000000001e-131  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  31.71 
 
 
518 aa  100  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  32.38 
 
 
933 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  31.6 
 
 
948 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  28.23 
 
 
980 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  27.94 
 
 
1002 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  31.02 
 
 
922 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  30.61 
 
 
917 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  29.55 
 
 
948 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  34.16 
 
 
262 aa  62  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  29.95 
 
 
943 aa  62  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  27.9 
 
 
953 aa  60.5  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  30.73 
 
 
961 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  30.23 
 
 
286 aa  58.9  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  23.2 
 
 
908 aa  58.9  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  29.68 
 
 
262 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  27.78 
 
 
918 aa  57.4  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  29.94 
 
 
942 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  26.61 
 
 
917 aa  55.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  29.11 
 
 
941 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5630  hypothetical protein  23.37 
 
 
272 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5582  hypothetical protein  23.91 
 
 
272 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  26.4 
 
 
939 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  29.77 
 
 
321 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  26.29 
 
 
305 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  24.12 
 
 
392 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  25 
 
 
282 aa  43.5  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  24.29 
 
 
323 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>