43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1962 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  42.97 
 
 		 953 aa  689    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  42.56 
 
 		 942 aa  704    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  43.93 
 
 		 943 aa  731    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  40.35 
 
 		 922 aa  654    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  43.44 
 
 		 941 aa  723    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  43.5 
 
 		 980 aa  748    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  52.46 
 
 		 918 aa  958    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  100 
 
 		 917 aa  1878    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  45.04 
 
 		 948 aa  735    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  38.58 
 
 		 961 aa  619  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  37.4 
 
 		 908 aa  587  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  36.51 
 
 		 939 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  36.48 
 
 		 970 aa  554  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  36.83 
 
 		 925 aa  542  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  35.96 
 
 		 923 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  37.41 
 
 		 919 aa  538  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  35.28 
 
 		 948 aa  520  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  35.26 
 
 		 985 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  33.86 
 
 		 948 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  33.98 
 
 		 933 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  33.74 
 
 		 917 aa  446  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1002 aa  362  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  47.98 
 
 		 305 aa  233  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  44.19 
 
 		 321 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  26.47 
 
 		 795 aa  186  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  38.37 
 
 		 262 aa  181  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  24.24 
 
 		 764 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  26.26 
 
 		 282 aa  99.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  27.39 
 
 		 518 aa  98.2  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  27.35 
 
 		 286 aa  93.2  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  29.27 
 
 		 262 aa  89.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  26.42 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  27.54 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  27.1 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  23.43 
 
 		 258 aa  60.5  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  25.88 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  26.61 
 
 		 231 aa  55.8  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  25.1 
 
 		 462 aa  51.2  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  22.04 
 
 		 273 aa  51.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  25.19 
 
 		 357 aa  47  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  23.68 
 
 		 322 aa  46.6  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3133  hypothetical protein  23.35 
 
 		 314 aa  44.7  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 392 aa  44.3  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>