24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4072 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  100 
 
 		 764 aa  1480    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  27.51 
 
 		 795 aa  241  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  30.25 
 
 		 943 aa  213  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  27.45 
 
 		 941 aa  188  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  27.65 
 
 		 918 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  26.66 
 
 		 942 aa  168  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  24.72 
 
 		 939 aa  160  8e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  27.23 
 
 		 948 aa  154  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  26.25 
 
 		 970 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  27.32 
 
 		 922 aa  150  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  26.44 
 
 		 923 aa  144  6e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  24.28 
 
 		 980 aa  143  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  26.15 
 
 		 925 aa  141  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  26.15 
 
 		 919 aa  140  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  21.28 
 
 		 908 aa  140  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  26.23 
 
 		 948 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  26.11 
 
 		 933 aa  137  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  26.81 
 
 		 948 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  24.88 
 
 		 917 aa  137  9e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  23.15 
 
 		 953 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  23.54 
 
 		 961 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  25.4 
 
 		 1002 aa  99.8  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  23.32 
 
 		 917 aa  95.5  4e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  28.06 
 
 		 985 aa  84.3  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>