28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3067 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  71 
 
 		 985 aa  1360    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  100 
 
 		 919 aa  1863    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  96.76 
 
 		 925 aa  1779    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  48.45 
 
 		 980 aa  884    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  45.29 
 
 		 970 aa  753    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  41.49 
 
 		 961 aa  677    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  44.48 
 
 		 948 aa  735    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  49.78 
 
 		 948 aa  870    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  44.08 
 
 		 923 aa  736    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  46.41 
 
 		 953 aa  795    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  40.91 
 
 		 941 aa  624  1e-177  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  39.91 
 
 		 943 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  40.25 
 
 		 942 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  37.64 
 
 		 917 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  37.54 
 
 		 922 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  36.82 
 
 		 918 aa  505  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  34.39 
 
 		 933 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  34.79 
 
 		 948 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  32.15 
 
 		 939 aa  445  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  30.99 
 
 		 908 aa  419  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  30.98 
 
 		 917 aa  342  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1002 aa  194  9e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2975  hypothetical protein  37.17 
 
 		 795 aa  152  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.549239 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4072  hypothetical protein  26.15 
 
 		 764 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0374389  normal  0.138857 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  29.72 
 
 		 321 aa  106  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  34.07 
 
 		 305 aa  92.8  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  29.37 
 
 		 262 aa  75.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  28.82 
 
 		 286 aa  51.2  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>