34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1831 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1831  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  659    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124467 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4155  hypothetical protein  55.94 
 
 		 953 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432055  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2475  TM1410 hypothetical-related protein  51.53 
 
 		 980 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5290  hypothetical protein  53.29 
 
 		 961 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287428  normal  0.279625 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1499  hypothetical protein  55.73 
 
 		 305 aa  308  9e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.555638  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2276  putative signal peptide protein  53.05 
 
 		 948 aa  296  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806007  normal  0.316994 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5546  putative signal peptide protein  49.8 
 
 		 942 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1043  putative signal peptide protein  48.21 
 
 		 941 aa  248  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0016  polysaccharide deacetylase  47.91 
 
 		 922 aa  233  4.0000000000000004e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00621285 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0773  polysaccharide deacetylase  44.09 
 
 		 943 aa  219  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430568  normal  0.0849732 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3207  TM1410 hypothetical-related protein  44.98 
 
 		 918 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.107139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  44.19 
 
 		 917 aa  216  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  39.21 
 
 		 939 aa  201  9e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  39.59 
 
 		 262 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1736  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1002 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.525409  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  35.29 
 
 		 908 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1904  hypothetical protein  33.73 
 
 		 917 aa  138  1e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  36.11 
 
 		 933 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24480  hypothetical protein  33.2 
 
 		 948 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1491  hypothetical protein  30.12 
 
 		 970 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3067  hypothetical protein  29.37 
 
 		 919 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2975  hypothetical protein  30.8 
 
 		 923 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0958467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3413  hypothetical protein  29.67 
 
 		 925 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.443698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  30.16 
 
 		 286 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1839  hypothetical protein  28.8 
 
 		 948 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000860206 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3137  hypothetical protein  29.6 
 
 		 985 aa  89.7  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  24.4 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0372  TM1410 hypothetical-related protein  23.72 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  27.8 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  25.29 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  29.77 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1423  hypothetical protein  25.87 
 
 		 253 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.294221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1422  hypothetical protein  25.37 
 
 		 322 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.322242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  23.11 
 
 		 323 aa  42.7  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>