22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3272 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 
392 aa  808    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  37.31 
 
 
323 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
286 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  32.86 
 
 
485 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  25.98 
 
 
322 aa  113  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  29.03 
 
 
302 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  27.79 
 
 
368 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  26.89 
 
 
369 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  25.32 
 
 
448 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  26.38 
 
 
462 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1000  TM1410 hypothetical-related protein  25.73 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  27.68 
 
 
357 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2974  hypothetical protein  26.6 
 
 
282 aa  52.8  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.261416 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  23.11 
 
 
299 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  24.83 
 
 
286 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2432  putative signal peptide protein  21.92 
 
 
939 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0164247  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  23.55 
 
 
262 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2649  extracellular endo alpha-1 4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase-like  27.41 
 
 
374 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  24.34 
 
 
917 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0535  hypothetical protein  21.84 
 
 
908 aa  44.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000617771  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1836  hypothetical protein  24.12 
 
 
231 aa  43.9  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2073  hypothetical protein  23.13 
 
 
933 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>