18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2241 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  71.91 
 
 		 368 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  71.24 
 
 		 369 aa  433  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  27.24 
 
 		 485 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  25 
 
 		 448 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  24.47 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  22.58 
 
 		 286 aa  67  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 323 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  28.37 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  24.3 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  25.34 
 
 		 322 aa  59.7  0.00000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3735  hypothetical protein  25.09 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.756384  normal  0.0338258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  23.56 
 
 		 392 aa  55.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1000  TM1410 hypothetical-related protein  30 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  25.9 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1962  hypothetical protein  25.1 
 
 		 917 aa  48.5  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000223558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1647  putative signal peptide protein  24.64 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.053126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2649  extracellular endo alpha-1 4 polygalactosaminidase or related polysaccharide hydrolase-like  33.08 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>