22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2106 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2106  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  615  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.844619 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1420  cysteinyl-tRNA synthetase  29.28 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3272  cysteinyl-tRNA synthetase  29.03 
 
 		 392 aa  110  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  27.38 
 
 		 462 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  26.32 
 
 		 448 aa  90.9  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0991  cysteinyl-tRNA synthetase  29.49 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00231888  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0672  hypothetical protein  23.6 
 
 		 322 aa  83.6  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2446  TM1410 hypothetical-related protein  22.56 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2053  TM1410 hypothetical-related protein  22.9 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4070  hypothetical protein  26.24 
 
 		 357 aa  68.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141328  normal  0.0763536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2532  TM1410 hypothetical-related protein  25.12 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  28.57 
 
 		 485 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2241  hypothetical protein  24.3 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22100  hypothetical protein  33.71 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00255841 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1184  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase, putative  21.67 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1840  hypothetical protein  22.37 
 
 		 277 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1609  hypothetical protein  31.52 
 
 		 273 aa  52  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1621  putative signal peptide protein  22.22 
 
 		 286 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174255  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1498  hypothetical protein  23.86 
 
 		 391 aa  47  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3631  hypothetical protein  21.3 
 
 		 275 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0681  endo alpha-1,4 polygalactosaminidase precusor  30.3 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08154  conserved hypothetical protein  32.56 
 
 		 336 aa  44.3  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.809637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>