More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4254 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  86.26 
 
 		 546 aa  907    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  98.52 
 
 		 540 aa  1045    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 540 aa  1061    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  49.57 
 
 		 1029 aa  186  9e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  49.57 
 
 		 1029 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  41.11 
 
 		 574 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.64 
 
 		 1415 aa  147  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  43.97 
 
 		 531 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  43.53 
 
 		 531 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  41.22 
 
 		 357 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  39.22 
 
 		 614 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  43.95 
 
 		 621 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.61 
 
 		 1019 aa  128  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  37.04 
 
 		 1055 aa  127  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  38.55 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  37.35 
 
 		 395 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.1 
 
 		 3209 aa  119  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  46.71 
 
 		 475 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  46.9 
 
 		 1764 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  45.39 
 
 		 475 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  46.15 
 
 		 2954 aa  109  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  40.28 
 
 		 727 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  40.39 
 
 		 1855 aa  107  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  37.65 
 
 		 448 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  41.28 
 
 		 907 aa  107  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  43.11 
 
 		 2198 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  36.15 
 
 		 2807 aa  104  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.48 
 
 		 588 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  43.62 
 
 		 2133 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 2467 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  45.51 
 
 		 3026 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  37.4 
 
 		 1072 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.31 
 
 		 4334 aa  101  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  45.7 
 
 		 3954 aa  99.4  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  47.1 
 
 		 1112 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  43.17 
 
 		 1134 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  44 
 
 		 462 aa  97.1  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  41.3 
 
 		 535 aa  97.1  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  32.98 
 
 		 813 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  46.43 
 
 		 1133 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  38.07 
 
 		 820 aa  93.2  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  42.07 
 
 		 768 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  35.44 
 
 		 462 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  35.59 
 
 		 503 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  39.09 
 
 		 3608 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  42.95 
 
 		 448 aa  92.4  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.81 
 
 		 3619 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.76 
 
 		 2701 aa  92  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  37.56 
 
 		 3619 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  35.86 
 
 		 851 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  38.69 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  39.13 
 
 		 1650 aa  84.7  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4916  hemolysin-type calcium-binding region  34.69 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  39.52 
 
 		 1532 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  38.59 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.66 
 
 		 2678 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  36.4 
 
 		 260 aa  84.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  43.04 
 
 		 1079 aa  84  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  36.32 
 
 		 5171 aa  83.6  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.5 
 
 		 1197 aa  82.8  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  41.29 
 
 		 7284 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  37.89 
 
 		 1164 aa  82  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  40 
 
 		 745 aa  80.9  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  34.34 
 
 		 824 aa  81.3  0.00000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  35.27 
 
 		 1287 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  35.64 
 
 		 1712 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  42.64 
 
 		 2950 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.54 
 
 		 1180 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  33.88 
 
 		 2567 aa  78.2  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  33.45 
 
 		 606 aa  78.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  43.2 
 
 		 2097 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  37.72 
 
 		 1534 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.46 
 
 		 2775 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 565 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  35.5 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.59 
 
 		 1795 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  36.67 
 
 		 595 aa  77.4  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.78 
 
 		 1895 aa  77  0.0000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  38.82 
 
 		 1557 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  37.81 
 
 		 757 aa  76.6  0.0000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.05 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2509  hemolysin-type calcium-binding region  37.43 
 
 		 865 aa  75.5  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  29.08 
 
 		 1022 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  29.08 
 
 		 1017 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  29.85 
 
 		 652 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  33.06 
 
 		 1175 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  39.74 
 
 		 2911 aa  74.7  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  31.64 
 
 		 858 aa  74.7  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.7 
 
 		 980 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  41.94 
 
 		 946 aa  74.3  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.33 
 
 		 1403 aa  73.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  29.46 
 
 		 2667 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4726  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.51 
 
 		 826 aa  73.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.2 
 
 		 998 aa  73.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.69 
 
 		 1610 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  30.18 
 
 		 329 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  30.18 
 
 		 329 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 		 260 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>