More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4705 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  100 
 
 		 1133 aa  2177    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  46.14 
 
 		 1134 aa  748    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41 
 
 		 1415 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  40.77 
 
 		 2467 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  39.03 
 
 		 1764 aa  386  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  42.9 
 
 		 2807 aa  385  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  49.89 
 
 		 535 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  46.14 
 
 		 535 aa  354  4e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  40.12 
 
 		 2133 aa  334  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 		 3954 aa  331  4e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  41.28 
 
 		 2198 aa  280  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  39 
 
 		 851 aa  254  7e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.86 
 
 		 4334 aa  247  9e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  34.52 
 
 		 1855 aa  233  2e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.3 
 
 		 2954 aa  229  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  44.02 
 
 		 768 aa  221  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  38.44 
 
 		 1610 aa  221  7.999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.8 
 
 		 2097 aa  219  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  33.51 
 
 		 3026 aa  213  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  42.02 
 
 		 907 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  29.4 
 
 		 745 aa  204  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.48 
 
 		 2911 aa  201  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.45 
 
 		 648 aa  197  6e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  46.72 
 
 		 395 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  37.29 
 
 		 1610 aa  194  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  43.59 
 
 		 395 aa  194  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  39.95 
 
 		 3209 aa  193  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  37.95 
 
 		 3608 aa  186  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  33.49 
 
 		 2950 aa  179  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  32.27 
 
 		 1534 aa  178  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.13 
 
 		 1112 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  28.83 
 
 		 1112 aa  171  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  31.71 
 
 		 727 aa  171  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.65 
 
 		 820 aa  167  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  39.34 
 
 		 3619 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  37.04 
 
 		 3619 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  29.07 
 
 		 1582 aa  162  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.04 
 
 		 1145 aa  160  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  35.41 
 
 		 1532 aa  156  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  29.14 
 
 		 1628 aa  152  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  34.38 
 
 		 476 aa  151  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  34.6 
 
 		 481 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  36.28 
 
 		 504 aa  148  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  40.56 
 
 		 531 aa  147  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  40.21 
 
 		 531 aa  145  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  43.94 
 
 		 1029 aa  144  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  43.94 
 
 		 1029 aa  144  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  28.63 
 
 		 1213 aa  143  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  39.31 
 
 		 614 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  32.77 
 
 		 474 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  35.64 
 
 		 478 aa  141  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  32.95 
 
 		 475 aa  140  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  32.86 
 
 		 476 aa  138  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  28.39 
 
 		 1390 aa  136  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  31.67 
 
 		 468 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  33.04 
 
 		 479 aa  137  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  35.28 
 
 		 574 aa  135  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  29.61 
 
 		 824 aa  134  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  33.63 
 
 		 480 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.57 
 
 		 1079 aa  130  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  30.61 
 
 		 490 aa  130  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  35.9 
 
 		 467 aa  128  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  30.97 
 
 		 479 aa  125  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  33.78 
 
 		 503 aa  124  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  35.21 
 
 		 475 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  35.21 
 
 		 475 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.99 
 
 		 1197 aa  124  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  29.8 
 
 		 513 aa  122  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.02 
 
 		 4800 aa  121  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  46.83 
 
 		 462 aa  121  9e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.96 
 
 		 2701 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  35.06 
 
 		 759 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.34 
 
 		 2678 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  40.28 
 
 		 503 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  34.06 
 
 		 444 aa  114  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  34.06 
 
 		 442 aa  114  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.37 
 
 		 833 aa  114  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.81 
 
 		 928 aa  112  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  33.75 
 
 		 444 aa  111  7.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  32.98 
 
 		 486 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  27.75 
 
 		 2836 aa  111  9.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  29.56 
 
 		 1072 aa  110  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  32.99 
 
 		 785 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  28.84 
 
 		 1400 aa  108  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  28.89 
 
 		 606 aa  108  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.63 
 
 		 1269 aa  108  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.63 
 
 		 1269 aa  108  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.37 
 
 		 2775 aa  107  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  30.68 
 
 		 556 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.65 
 
 		 1279 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  32.1 
 
 		 681 aa  102  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  31.3 
 
 		 946 aa  101  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.34 
 
 		 768 aa  97.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 		 677 aa  97.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  27.28 
 
 		 1164 aa  97.1  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  29.48 
 
 		 965 aa  95.5  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  26.49 
 
 		 764 aa  94  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4916  hemolysin-type calcium-binding region  32.82 
 
 		 452 aa  94.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21271  hypothetical protein  34.83 
 
 		 484 aa  93.6  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  27.23 
 
 		 1544 aa  92.8  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>