Gene Suden_1200 details

Gene Information

• Locus tag: Suden_1200
• ID: 3763561
• Type: CDS
• Is gene spliced: No
• Is pseudo gene: No
• Organism name: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251
• Kingdom: Bacteria
• Replicon accession: NC_007575
• Strand: -
• Start bp: 1261963
• End bp: 1267557
• Gene Length: 5595 bp
• Protein Length: 1864 aa
• Translation table: 11
• GC content: 37%
• Product: hemolysin-type calcium-binding region
• Protein accession: YP_393713
• Protein GI: 78777398

Plasmid Coverage information

• Num covering plasmid clones: 0
• Plasmid unclonability p-value: 0.0007986
• Plasmid hitchhiking: No
• Plasmid clonability: unclonable

Fosmid Coverage information

• Num covering fosmid clones: n/a
• Fosmid unclonability p-value: n/a
• Fosmid Hitchhiker: n/a
• Fosmid clonability: n/a

Sequence

Gene sequence

ATGGCATTAG AAGTAAATAG CAAAAGTATA GAGTACAAAG ACAATAAAGT TATTATAAAG 
AGCATGCCAA AAGATGGCGA GAATCTATCA GTTTTTATAA GACCGGGAGA CGAAGTTGTT 
TTTGATATAG ATGGTGTTAC TTCTGATGAA CTCGATTATG CTCTTGTTGG TGGAGATATC 
GTTGTTGAGT TTCCAGGACT TGGTGCTTTA ACGTTCCCAT CTATGGGATT AATGAGCTTT 
AGCAGTAATC CTCCTCAGTT TAATTTTAGC GGAAAATTAT TTTCGGTAGA AAATCTTCTC 
TCAAAAATTC AAGAGATAAA TGAGCTCCCT ATTACTTCTG TTGATGCCAG TTTTAAGGTT 
AGGGTGAGCG ATACTGATGA AGATAAAGGA TTGATGCACA ATAAGCCAGA CATGGCATCT 
CCAGCTCCAA TCATCATAGT CCCACAATCT CAAGTTTTAC CAGATTCCTA CAATAAAAAA 
GAAGATTTTA CTCAAACTCA ACAAGAGGTT AGAAAAGATT ATAGAAGCGA TTCCGAAGCT 
ATAGCAAAAA GCAACACTGT ACCAAATTCC TACACAAAAC CGTATGCAAG CTACGCAAAA 
CCAAATGATT TTGATGCCTA TAAACCTAAA GAGGAGATGA TTCCAAAGCC AGATGTGGAG 
ATGATTCCAA AGCCAGATGT GGAGATGATT CCAAAGCCAG ATTATGAAAC TATGCCAAAA 
AATGATTTCA CTGACTATTT TCCAGAAAAT AATTATACTG GTTATGGCGA TGGCAACGGA 
GATGGCGTTG GACCTGGAGA AGGAATCCCA AGTTTTGGGT TTAAAGCAAC TGCGCATCAA 
GTAAGGTTTA GTGAAGTCTT AAATGCAGAT AACACACCTG AAATATTAGG TGGTGGCGGA 
AGCGTGGCTG GATATAAGTT TGACTCTGTT AGTGATCAGT ACAAACCAGA GACCATAGAC 
ATAAGCAATA GAACTGAAAA TATGGTTATA AGAGCTGAAA ATAGCGACTA CTTTAGTAAT 
GCTCCTTCAG CTAAAACAGG AGTAAATGTT TTAACTTTTA AAGACCTAGC AAATGGAGAA 
TCAGTCACTA TAGATGGACT TACTCTAACT GCTAGTGGGG CTATTAGTGC AGCGGCTGTT 
GCCACAGGAT TTGCAAGTTT AGCAGCAAGT TCAGATGGAA TTTTAAATAC AGTAACTAAC 
GGTGCATGGA GCGGAACATT ATCCGCTGGA TGGAGTTCTG CTGCTGCAGC TGGAGATAAA 
GTCACTTTTA CAAGTACAGC AGCAAATAAT AATATAACTA CTTTTGTAAC CTCTTCATTA 
GGCTCAACAC CAGTAGATGT CGTTCATTCA GAACCTTCTA CAGATGTTTA TTTATCAAGA 
GTTTTACGTT TTGAGCCTAA TATGCCTGAG GGTTTTTATG TTGATAGCTT CTCTATCAGT 
GGTCTTCCTT CTGGGGTTAA GATTTTAGAT AAAGATTCCA ATGAAATATC TGGTTCTAAT 
ATTTCAAAAG AGAATATGAT TTTTAAAAAT GCACTAGGTG AAGTTATTGC ATATGATAGC 
GTAGATTTTT TGACTAACTT TAAAAGTGCA GAATTTACTA TAAAATATCC AAACAATATA 
TCAGCTCCAT TTAATGTCTC CATAACTGCT AACTACAAAG TAGATGCAGC TTTTGCTGAT 
AGTGTAACAG AGAGTGAGCA GTCTTTCACG AATGAGTACA CTTTTGCACT AAAAGATATA 
ACTTCTGCTG ATGATTATAC ATATAAAAAA GCTGATTTCG CAGGTGGCAA AGATGAGGGA 
TTTATCTTAT CAAAAGAACC AAACTACAAC ATTATAAAAG ATGGTAGCGG AGATAACATC 
ATATATGGCG GAATAGTAAA AGATGTTGTT TATGACGCTG CAGGAGATGA TACTTACTAC 
CTTAGTGCAG GCGATGATAC TCTTTATGGT GGAAGCGGAA CAAATCGTAT ATATGGCGAT 
AATGATAATG GTAGTGCCGA GACTAAAAAA TATGATGGTA AAGATACCGT CAGTTATGAA 
AATGTAAATA GTTTTGGGAT TAGTGAAATT GAGCTTCTTA GCAATGAGGG GGCTATCACT 
GCACAAGAGA GTCAAAAATT AGGTGGCTCG TATGATGAAG ACAGTGATCC AAGCACATCC 
AATCCGCTAA ATGTAGATAT GTTAGTCTCT TACAAAGGTG TGTATGTTGA CTTAGATGGC 
GTACATGTAG ATGGTTTAAA TATTGATGTT GATGGTGATG GTGATATAGA TGCAGATGAT 
AAAATAAATG CAATTTCAAA ATTTGCCAAC AGAGATGGGA GATTTACTTA TGATGCTGAT 
GGCTATGCAA TTGGTACCTC TATAGGTAAA ACAATAACTT TTACAAGCAT AACGTCAAAT 
GCGCAAGTTG ATGATATTAC TGTTGTAGCC TCAGGAGTAG AAACAGTTGC AGCACCTACA 
GCACTTGGTG TAGTATCTAT TCAAGGAGTT GATGCAACTA CAACAGAGAG TCATGAGATT 
ACATTTCAAG ATTTAATCGC TGGACAGTCT GTAACTGTAG ATGGACTAAA ACTAACTGCT 
ACTGGAGCGA TTTCTGCAGC TGATGTTGCT GCTGGTTTTT CCTCTCTTGA TAATAGTGCT 
GCAACAGCTG GTTCTGCTGT AACTAACGGT ACATGGAGTG GTGCAAAAAC TACAGCATGG 
ACTTCAGGCG GAGCCACTGG TGCTGTTGTG ACTTTTACAA GCCAAACTGC GACAACAGCT 
GTTGATGACA TAGTTACCGC ATCAGCTGGT GTTAGTGGTA TTGACACTCC AGCTATTGAT 
GTTGCTATCA CTCAAGGAAG TAGCGATATT GACACAAAAC AGAGTGAAAA AGCAACTATT 
GTTTTTAAAG ATTTGATAGC TGGACAATCA CTTAGTGTTG GAGGATTAAC ACTAAGCGCA 
ACGGGAGCCA TTAGTGCGGC TAGTGTTGCG GCAGGCTTTG CTTCTTTAAG CGCTGGTGCA 
ACTGCTGGTA ACGCTGTGGC AAATGGTACT TGGAGTGGAA CCCTTGGCTC TTTTTCATCA 
TCAAAGCAGG AGAGTGGACT AGATAGCATT CAAGCAACTG GATATGATAT TTATAAAGAT 
ATTGAAAATA TTACGGGAAG TAAATACAAC GATACTATTT ATGGAAATTT AACTAAAGAT 
AATACTCTTA GTGGACTTGG CGGAAGTGAT ACTATAGATG GCAGAGGTGG AAACAATAAA 
CTCTATGGCG GAGATGGAGG CGATACTCTT ATCTCTGGAA GCGGCAAAGA TTATATAGAT 
GGAGGAGCTG ACACTGACAC TGTAAGTTAT GTAAATATGA TTGAGGGTGT GAGAGTAAGA 
CTTGATAGAC CAAATGGTGA AGAGTATGAT TATGCGCATC TCAATAGTGA CCTTGTTAAC 
GAAAAAGACA GGATTCTTAA TGTAGAAAAT ATTACAGGTT CTTCATATGA TGATACTATT 
TATGGGAATG CAAATACAAA CTTTATCAAA GGTGGCGCTG GAGATGACCG CATCTTTGCT 
GGTGGAGGTT ATGACTTCAT AGATGGTGGA GCTGGAAGCG ACTGGATAAC ATATAAACCT 
TCAGATTATG ATTTCAATAC TACTAAGCCT AGTTTTATGG AGACATTTCA AGGTATTACA 
GTTGATTTAA ATAGTAGTGA TTTTGTTATG GTAAAAGAGA CAGCTACTGA CAACTTGATA 
GATTTGATAA AAGATATAGA AAAAATTAGT GCAACTGATG GTATAGATAA AATATATGGT 
TCAAACAGTG CTGATGAAGA GTTTTGGGGA TGGGGTGGAA ATGATATACT TTATGGAAGA 
GGCGGAAATG ACATACTTCA TGGTGGAAGC GGAGATGATT ACATCAGACC TGGACGTGGA 
GTTGATAAGA GTTATGGAGA TACTGGAGAT AACTATCTAG AGTTATATGA TGATGGAGTA 
AAAGATAAAG CGTTTCAAGC TATTAGGCTT AACTCAGATG GTAAAGTTCA GCATAAACTT 
GTAGCTGGTG ATGGCAGTTG GATTGATGGG TACAATTCTA TTGATGGACT CGAAATTGCA 
GAAGGATTTA GCGGTATCGG TTTGGGCAAT GGTACTAATG ATGAGATACA TGGAAATGAA 
CTTGCTAATA TCATTAATGG TTATGGCGGA GATGATGATA TTTATGGTTA TGGCGGAGAT 
GATACCATTA GAGGTGGTTC TGGTAAAGAT AAGATTTACG GTGGAGCTGG TAAAGACATA 
ATATATGGTG ATCAAGATGA TGACACCATA GACGCAGGGG ATGGAGATGA CACTGTTTAT 
GGTTATGGCA GATATACCAC AGGTCAAACA AATAATGACA AAATAGATGG TGGAGATGGA 
TTTGATACAA TCGACTATAG CACAACTTCT GATGCGATAA CGCTTAATTT AGGAAATGTT 
GTAGGTGGTT ATGCAACAGT AGAGTTTCTA TCAGCCACTG GAACAGCTGG AATATATAAT 
GACTTAATCA AAAATTTTGA GTCAGTTGTC GGCTCAAGAG GAAATGATAC TATAACTGCG 
AACGATAGTG GTATGACGCT AGATGGCTGG AGTGGAGTAG ATAAGCTTTA TGGTGGAGCT 
GGAGCTGATA CTATCATAGC TAGAAATCAA GCAACTGAAA TTTTAGATGG AGGAGGGGGT 
AGCGATACTC TTAAACTTGC GCAAAATGTT GATTTTAGAA ATCAAACTAT TAGTAATTTT 
GAGATATTGG AACTTGGAAG TTATAACTCT TACTTTAATC TATCTCAATG GAGTTTGAAT 
AGCTTTACAA AAGTAGTCGG TGGAGATAAT AGTAGAATCT ACATGTATTC AACAAATACA 
GTTACTGATG ATAATTTTAA TTTTACTAAC ATTGACTTCA GTGATTTTAG TGGTAGCTTA 
TATGTTTCTG GATACAACGG AAATGATACA TATAATTTTA CAGGTTCTAC ACTAAGTGCA 
AATATGAACT TCTACTTAGA TGCTAGTAGT GGAACAGACA CCCTGATAAT GGGTGTAAAT 
CAAACCATAA ATATGCTAGA CAACTACTAC AACACATTTG AGACGTTTCA AATAGGTACA 
GATTCAAATT TAAACATTAA GGCTTATAAC GATAATGGAA GAACTTTTTA TGCTCACAAC 
AAAGATTTTA GTGCTGTAGA TGGTGATGTA AACCTTATTG GTGGAAGCGG AAATGATACT 
TTTTATGCAA ATTATGAAGC ACTTTTAGCT GGAAAACTAA ATATTGATGG GGGAAGCGGC 
AGTGATATGG TTGATGTTAG AACAACTCAA ACCAATGCAG CTTTGACATT TAATGATGCA 
GATATATTTA ATAATATTGA AAGATTAGAA CTTGACACAA TTTCTAGTAC AAATAGTATA 
AATATAGATG CAAGAGCTAT GAAACAATGG ATTGGCAGTT CAAGTGAACT CACACTTGAT 
ATAGCAAATA ATACACAAGG TACTAAAGTC ACTATTGACA ATACCAAAGG TGATGATATG 
ACAAACTTTA CAATAGGACA AAGCTACACT ATCACATTGG ATGATAATAC AAGTTTTGCT 
ATGCATGTAG TTTAA 

 

Protein sequence

MALEVNSKSI EYKDNKVIIK SMPKDGENLS VFIRPGDEVV FDIDGVTSDE LDYALVGGDI 
VVEFPGLGAL TFPSMGLMSF SSNPPQFNFS GKLFSVENLL SKIQEINELP ITSVDASFKV 
RVSDTDEDKG LMHNKPDMAS PAPIIIVPQS QVLPDSYNKK EDFTQTQQEV RKDYRSDSEA 
IAKSNTVPNS YTKPYASYAK PNDFDAYKPK EEMIPKPDVE MIPKPDVEMI PKPDYETMPK 
NDFTDYFPEN NYTGYGDGNG DGVGPGEGIP SFGFKATAHQ VRFSEVLNAD NTPEILGGGG 
SVAGYKFDSV SDQYKPETID ISNRTENMVI RAENSDYFSN APSAKTGVNV LTFKDLANGE 
SVTIDGLTLT ASGAISAAAV ATGFASLAAS SDGILNTVTN GAWSGTLSAG WSSAAAAGDK 
VTFTSTAANN NITTFVTSSL GSTPVDVVHS EPSTDVYLSR VLRFEPNMPE GFYVDSFSIS 
GLPSGVKILD KDSNEISGSN ISKENMIFKN ALGEVIAYDS VDFLTNFKSA EFTIKYPNNI 
SAPFNVSITA NYKVDAAFAD SVTESEQSFT NEYTFALKDI TSADDYTYKK ADFAGGKDEG 
FILSKEPNYN IIKDGSGDNI IYGGIVKDVV YDAAGDDTYY LSAGDDTLYG GSGTNRIYGD 
NDNGSAETKK YDGKDTVSYE NVNSFGISEI ELLSNEGAIT AQESQKLGGS YDEDSDPSTS 
NPLNVDMLVS YKGVYVDLDG VHVDGLNIDV DGDGDIDADD KINAISKFAN RDGRFTYDAD 
GYAIGTSIGK TITFTSITSN AQVDDITVVA SGVETVAAPT ALGVVSIQGV DATTTESHEI 
TFQDLIAGQS VTVDGLKLTA TGAISAADVA AGFSSLDNSA ATAGSAVTNG TWSGAKTTAW 
TSGGATGAVV TFTSQTATTA VDDIVTASAG VSGIDTPAID VAITQGSSDI DTKQSEKATI 
VFKDLIAGQS LSVGGLTLSA TGAISAASVA AGFASLSAGA TAGNAVANGT WSGTLGSFSS 
SKQESGLDSI QATGYDIYKD IENITGSKYN DTIYGNLTKD NTLSGLGGSD TIDGRGGNNK 
LYGGDGGDTL ISGSGKDYID GGADTDTVSY VNMIEGVRVR LDRPNGEEYD YAHLNSDLVN 
EKDRILNVEN ITGSSYDDTI YGNANTNFIK GGAGDDRIFA GGGYDFIDGG AGSDWITYKP 
SDYDFNTTKP SFMETFQGIT VDLNSSDFVM VKETATDNLI DLIKDIEKIS ATDGIDKIYG 
SNSADEEFWG WGGNDILYGR GGNDILHGGS GDDYIRPGRG VDKSYGDTGD NYLELYDDGV 
KDKAFQAIRL NSDGKVQHKL VAGDGSWIDG YNSIDGLEIA EGFSGIGLGN GTNDEIHGNE 
LANIINGYGG DDDIYGYGGD DTIRGGSGKD KIYGGAGKDI IYGDQDDDTI DAGDGDDTVY 
GYGRYTTGQT NNDKIDGGDG FDTIDYSTTS DAITLNLGNV VGGYATVEFL SATGTAGIYN 
DLIKNFESVV GSRGNDTITA NDSGMTLDGW SGVDKLYGGA GADTIIARNQ ATEILDGGGG 
SDTLKLAQNV DFRNQTISNF EILELGSYNS YFNLSQWSLN SFTKVVGGDN SRIYMYSTNT 
VTDDNFNFTN IDFSDFSGSL YVSGYNGNDT YNFTGSTLSA NMNFYLDASS GTDTLIMGVN 
QTINMLDNYY NTFETFQIGT DSNLNIKAYN DNGRTFYAHN KDFSAVDGDV NLIGGSGNDT 
FYANYEALLA GKLNIDGGSG SDMVDVRTTQ TNAALTFNDA DIFNNIERLE LDTISSTNSI 
NIDARAMKQW IGSSSELTLD IANNTQGTKV TIDNTKGDDM TNFTIGQSYT ITLDDNTSFA 
MHVV