More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3220 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  100 
 
 		 713 aa  1432    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  98.32 
 
 		 713 aa  1414    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  52.93 
 
 		 781 aa  414  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  51.95 
 
 		 782 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  49.55 
 
 		 763 aa  411  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  35.13 
 
 		 785 aa  121  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  38.66 
 
 		 481 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  35.37 
 
 		 479 aa  114  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  40.99 
 
 		 478 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  29.12 
 
 		 745 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  34.69 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  38.14 
 
 		 480 aa  109  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  39.3 
 
 		 486 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  38.31 
 
 		 475 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  39.01 
 
 		 504 aa  104  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  38.55 
 
 		 476 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  37.05 
 
 		 474 aa  100  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  27.96 
 
 		 648 aa  99  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  36.84 
 
 		 490 aa  99  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  37.39 
 
 		 476 aa  97.8  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  34.27 
 
 		 727 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  30.12 
 
 		 513 aa  93.6  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  36.69 
 
 		 1134 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  36.1 
 
 		 1631 aa  87.8  6e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  36.06 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  37.6 
 
 		 820 aa  84.3  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  33.49 
 
 		 535 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  50.88 
 
 		 539 aa  81.6  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  32.16 
 
 		 442 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  32.16 
 
 		 444 aa  82  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  34.42 
 
 		 535 aa  81.3  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  34.43 
 
 		 1133 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  31.72 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  33.33 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  33.04 
 
 		 656 aa  77.4  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  27.21 
 
 		 681 aa  75.5  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  32.81 
 
 		 451 aa  73.2  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.81 
 
 		 1269 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.81 
 
 		 1269 aa  71.6  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  24.59 
 
 		 768 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.64 
 
 		 2182 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  30.29 
 
 		 606 aa  70.5  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  55.07 
 
 		 3977 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.57 
 
 		 2911 aa  69.7  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  47.96 
 
 		 2950 aa  68.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  36.25 
 
 		 531 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  42.39 
 
 		 593 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  44.09 
 
 		 4798 aa  66.2  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  35.83 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  40.21 
 
 		 768 aa  65.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  29.44 
 
 		 688 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.6 
 
 		 3427 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  50.7 
 
 		 1526 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  36.36 
 
 		 1499 aa  65.1  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 1582 aa  65.1  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  54.39 
 
 		 1168 aa  64.7  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  42.99 
 
 		 1544 aa  64.7  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  41.12 
 
 		 2537 aa  64.7  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  56.14 
 
 		 874 aa  64.3  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.03 
 
 		 1156 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 		 361 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  45.05 
 
 		 2342 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  29.22 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  46.84 
 
 		 1712 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  45.05 
 
 		 2342 aa  63.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  46.25 
 
 		 3209 aa  62.4  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  37.74 
 
 		 2887 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  38.53 
 
 		 574 aa  62  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  57.38 
 
 		 2743 aa  62.4  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  32.07 
 
 		 1112 aa  61.6  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  37.36 
 
 		 928 aa  61.6  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  40.32 
 
 		 1164 aa  61.2  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  57.89 
 
 		 5098 aa  61.2  0.00000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  41.51 
 
 		 2775 aa  60.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  38.39 
 
 		 5094 aa  61.2  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  41.07 
 
 		 1480 aa  61.2  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  53.52 
 
 		 856 aa  60.8  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 3954 aa  60.8  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  35.16 
 
 		 615 aa  60.1  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  54.24 
 
 		 5218 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  38.85 
 
 		 946 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  51.61 
 
 		 1286 aa  60.1  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.72 
 
 		 1180 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  31.44 
 
 		 1112 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  28.57 
 
 		 1557 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  33.52 
 
 		 1424 aa  59.3  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  29.49 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  40.95 
 
 		 467 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  37.91 
 
 		 518 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  36.13 
 
 		 932 aa  59.3  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  36.28 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  47.44 
 
 		 2107 aa  58.9  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  36.28 
 
 		 361 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  51.81 
 
 		 833 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 1963 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  59.26 
 
 		 4687 aa  58.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  43.42 
 
 		 1814 aa  58.2  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  56.86 
 
 		 1538 aa  58.2  0.0000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.26 
 
 		 928 aa  58.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  48.1 
 
 		 1699 aa  58.2  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>