More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1699 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  100 
 
 
593 aa  1217    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  47.21 
 
 
574 aa  511  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1895  hypothetical protein  44.66 
 
 
1025 aa  198  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  34.26 
 
 
2182 aa  108  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.62 
 
 
3977 aa  104  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  41.8 
 
 
2950 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.66 
 
 
1424 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38 
 
 
3954 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  44.34 
 
 
2775 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.42 
 
 
1180 aa  77.4  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  34.87 
 
 
768 aa  77.4  0.0000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  36.62 
 
 
782 aa  70.9  0.00000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  36.27 
 
 
615 aa  69.3  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  51.56 
 
 
1526 aa  68.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  35.21 
 
 
781 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  41.24 
 
 
2911 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  42.39 
 
 
713 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  42.39 
 
 
713 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  37.61 
 
 
5094 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  39.45 
 
 
3587 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0491  outer membrane adhesin like proteiin  33.52 
 
 
7149 aa  63.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  38.26 
 
 
3091 aa  63.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  35.54 
 
 
1805 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.7 
 
 
3427 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.39 
 
 
2678 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  43.43 
 
 
1079 aa  62  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  51.67 
 
 
1814 aa  62  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  37.82 
 
 
999 aa  62.4  0.00000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  37.86 
 
 
932 aa  61.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  38.61 
 
 
2887 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
928 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  49.21 
 
 
2542 aa  60.8  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  35 
 
 
1963 aa  61.2  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  36.7 
 
 
1764 aa  60.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  36.97 
 
 
1480 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  43.06 
 
 
417 aa  59.7  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 
2537 aa  60.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  37.63 
 
 
1538 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  35.87 
 
 
656 aa  59.3  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  47.37 
 
 
232 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  37.37 
 
 
1699 aa  58.9  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  35.14 
 
 
313 aa  58.9  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  36.46 
 
 
2784 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  33.59 
 
 
1019 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  33.61 
 
 
4798 aa  58.2  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  37.61 
 
 
486 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  46.77 
 
 
1055 aa  58.2  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  49.32 
 
 
2885 aa  57.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  35.14 
 
 
313 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.73 
 
 
577 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  36.11 
 
 
1582 aa  57.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  42.11 
 
 
2342 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.17 
 
 
1236 aa  57.4  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  42.11 
 
 
2342 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  46.05 
 
 
2689 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  50.79 
 
 
280 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
2346 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  52.83 
 
 
5218 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  39.33 
 
 
763 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  60.42 
 
 
3314 aa  56.6  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  55.56 
 
 
2329 aa  56.6  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  58 
 
 
1534 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 
2704 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.36 
 
 
2667 aa  56.2  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1049  hemolysin-type calcium-binding region  41.56 
 
 
370 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.416377  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  24.1 
 
 
1757 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  38.53 
 
 
851 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  52.54 
 
 
980 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  35 
 
 
1610 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  43.02 
 
 
688 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  33.65 
 
 
2245 aa  55.5  0.000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  28.99 
 
 
595 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  48.44 
 
 
3598 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  35.2 
 
 
1072 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  41.18 
 
 
8682 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 
534 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  42.35 
 
 
6753 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  49.21 
 
 
280 aa  54.7  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  41.18 
 
 
9030 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  48.33 
 
 
9867 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  47.95 
 
 
2807 aa  54.7  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  52.24 
 
 
2768 aa  54.7  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  35.79 
 
 
785 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  49.23 
 
 
1883 aa  54.7  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  48.28 
 
 
375 aa  54.3  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  37.89 
 
 
1372 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  41.03 
 
 
4106 aa  54.3  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  35.64 
 
 
5171 aa  54.3  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  48.08 
 
 
1306 aa  54.3  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  40.48 
 
 
7284 aa  54.3  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0313  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.28 
 
 
4836 aa  54.3  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.971398 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  46.77 
 
 
2296 aa  53.9  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  51.61 
 
 
303 aa  53.9  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  50.82 
 
 
1022 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  37.89 
 
 
1383 aa  53.9  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.58 
 
 
5098 aa  53.9  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  37.66 
 
 
1141 aa  53.9  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  40 
 
 
4687 aa  53.9  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
202 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  46.03 
 
 
5962 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>