More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1049 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1049  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 370 aa  711    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.416377  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0533  hemolysin-type calcium-binding region  72.24 
 
 		 359 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.695548  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  42.66 
 
 		 946 aa  85.9  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.15 
 
 		 2667 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  35.94 
 
 		 1043 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  35.66 
 
 		 4334 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  40.26 
 
 		 491 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.17 
 
 		 3427 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 518 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  34.92 
 
 		 3954 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.25 
 
 		 588 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  39.24 
 
 		 1424 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  34.56 
 
 		 1164 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  40.99 
 
 		 1286 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  39.06 
 
 		 2954 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.25 
 
 		 1279 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.4 
 
 		 1883 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.84 
 
 		 1236 aa  72.8  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  31.46 
 
 		 1287 aa  73.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  37.63 
 
 		 1055 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  36.58 
 
 		 820 aa  72.8  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  31.78 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  35.64 
 
 		 3209 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  35.46 
 
 		 615 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  31.69 
 
 		 526 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  34.52 
 
 		 1499 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  34.17 
 
 		 1895 aa  70.1  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  31.46 
 
 		 3598 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  32.87 
 
 		 769 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 		 1884 aa  69.7  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  32.42 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.89 
 
 		 1363 aa  69.7  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.54 
 
 		 980 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  37.96 
 
 		 387 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  40.69 
 
 		 1079 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  37.18 
 
 		 1855 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  36.44 
 
 		 1400 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  34.3 
 
 		 3619 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  33.88 
 
 		 3619 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  47.5 
 
 		 1156 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  35.62 
 
 		 2689 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.1 
 
 		 1534 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  41.9 
 
 		 5171 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  38.92 
 
 		 744 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  36.48 
 
 		 1532 aa  67  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.56 
 
 		 1795 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  31.38 
 
 		 3094 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  36.97 
 
 		 813 aa  66.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.04 
 
 		 1963 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  56.72 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  34.95 
 
 		 2145 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.33 
 
 		 595 aa  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  35.22 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.87 
 
 		 2911 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  36.61 
 
 		 4723 aa  65.1  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  36.51 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  31.14 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  46.81 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.68 
 
 		 2678 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.77 
 
 		 2107 aa  64.3  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  51.19 
 
 		 2329 aa  63.9  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.39 
 
 		 2105 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  35.6 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  38 
 
 		 460 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.82 
 
 		 2668 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.7 
 
 		 4800 aa  63.2  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  42.73 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  35.38 
 
 		 982 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.42 
 
 		 1019 aa  63.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  35.25 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  29.92 
 
 		 1544 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  33.58 
 
 		 2775 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  40.43 
 
 		 507 aa  62.8  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  35.56 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  42.24 
 
 		 686 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  33 
 
 		 219 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  34 
 
 		 9867 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 221 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  40.19 
 
 		 833 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  40.2 
 
 		 950 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  43.48 
 
 		 942 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  56.45 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1995  Hemolysin-type calcium-binding region  30.84 
 
 		 257 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0203272  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  37.24 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  50.7 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.52 
 
 		 3608 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  33.06 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  31.62 
 
 		 3026 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  30.58 
 
 		 682 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  38.26 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  47.92 
 
 		 4798 aa  60.1  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  32.13 
 
 		 734 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 2467 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  41.23 
 
 		 928 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  47.67 
 
 		 2885 aa  60.1  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  55.56 
 
 		 998 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  43.33 
 
 		 757 aa  60.1  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  64 
 
 		 3314 aa  60.1  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.12 
 
 		 1197 aa  60.1  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  51.69 
 
 		 1306 aa  60.1  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>