109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6774 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  100 
 
 		 641 aa  1296    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  91.82 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  68.42 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  66.34 
 
 		 343 aa  265  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  65.7 
 
 		 346 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  65.07 
 
 		 342 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  38.65 
 
 		 606 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  37.83 
 
 		 861 aa  178  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  45.02 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  50.27 
 
 		 493 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  47.89 
 
 		 848 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  42.41 
 
 		 743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  52.6 
 
 		 447 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  51.61 
 
 		 465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  42.78 
 
 		 465 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  39.3 
 
 		 1050 aa  137  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  41.71 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  43.79 
 
 		 452 aa  127  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  44.51 
 
 		 516 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  41.03 
 
 		 460 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  43.71 
 
 		 418 aa  123  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  48.8 
 
 		 363 aa  122  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  33.98 
 
 		 478 aa  120  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  38.92 
 
 		 283 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  33.23 
 
 		 474 aa  117  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  33.55 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  32.15 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  30.96 
 
 		 476 aa  112  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  39.29 
 
 		 594 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  31.73 
 
 		 504 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  31.8 
 
 		 490 aa  110  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  40.29 
 
 		 738 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  36.51 
 
 		 425 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  42.93 
 
 		 1503 aa  104  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  31.52 
 
 		 727 aa  104  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  31.58 
 
 		 444 aa  104  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  28.53 
 
 		 479 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  31.58 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  37.74 
 
 		 468 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  30.75 
 
 		 476 aa  101  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  31.6 
 
 		 442 aa  100  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  35.32 
 
 		 479 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  29.72 
 
 		 785 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  38.42 
 
 		 561 aa  97.1  8e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  30.31 
 
 		 475 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  36.32 
 
 		 486 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  28.45 
 
 		 531 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  29.41 
 
 		 531 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 		 792 aa  90.5  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  41.89 
 
 		 353 aa  89.7  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  29.47 
 
 		 1631 aa  89  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  38.36 
 
 		 833 aa  86.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  38.78 
 
 		 273 aa  87  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  35.81 
 
 		 1462 aa  84.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  41.86 
 
 		 266 aa  83.6  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  35.08 
 
 		 340 aa  83.2  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  32.38 
 
 		 614 aa  83.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  41.86 
 
 		 266 aa  83.2  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  35.57 
 
 		 364 aa  80.1  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  39.31 
 
 		 292 aa  80.1  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  40.69 
 
 		 352 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  34.78 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  39.04 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  35.71 
 
 		 526 aa  78.6  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  37.06 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1804  hypothetical protein  32.73 
 
 		 338 aa  76.6  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.269337  normal  0.0111784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  38.36 
 
 		 354 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  30.87 
 
 		 644 aa  76.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  28.9 
 
 		 535 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  33.57 
 
 		 950 aa  75.5  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.04 
 
 		 820 aa  74.7  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  36.99 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  33.15 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1272  hypothetical protein  39.22 
 
 		 351 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  34 
 
 		 589 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  36.42 
 
 		 207 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  30.41 
 
 		 387 aa  72  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  36.42 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  34.48 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  32.27 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  27.68 
 
 		 1134 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1283  hypothetical protein  60 
 
 		 190 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00921825  normal  0.841233 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  30.34 
 
 		 1043 aa  68.6  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  37.75 
 
 		 369 aa  68.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  27.79 
 
 		 535 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1206  hypothetical protein  30.46 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  30.45 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  33.11 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  27.87 
 
 		 1112 aa  64.7  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  33.53 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  27.52 
 
 		 745 aa  63.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  25.27 
 
 		 1112 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  29.31 
 
 		 648 aa  63.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  26.27 
 
 		 513 aa  62  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  32.89 
 
 		 530 aa  61.6  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  28.14 
 
 		 486 aa  60.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  27.3 
 
 		 1133 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5018  Hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 		 763 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0553928  normal  0.0814089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  26.09 
 
 		 713 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  25.75 
 
 		 713 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>