41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3177 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  70.8 
 
 		 480 aa  709    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  78.96 
 
 		 480 aa  810    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  79.58 
 
 		 480 aa  820    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  77.92 
 
 		 480 aa  808    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  989    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  69.04 
 
 		 478 aa  701    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  68.83 
 
 		 478 aa  700    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  78.96 
 
 		 480 aa  812    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  68.83 
 
 		 478 aa  701    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  33.72 
 
 		 1408 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  34.76 
 
 		 1410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  34.76 
 
 		 1410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  30.69 
 
 		 1107 aa  121  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  27.59 
 
 		 526 aa  120  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  27.84 
 
 		 524 aa  120  7e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  28.16 
 
 		 576 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  27.11 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  27.49 
 
 		 576 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  26.29 
 
 		 576 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  32.77 
 
 		 1422 aa  107  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  30.48 
 
 		 1108 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  26.04 
 
 		 501 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  28.87 
 
 		 826 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.22 
 
 		 921 aa  84  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  23.97 
 
 		 1222 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  29.08 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  29.71 
 
 		 624 aa  64.3  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  23.86 
 
 		 363 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  23.86 
 
 		 363 aa  60.1  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  24.59 
 
 		 743 aa  57.4  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  26.37 
 
 		 1129 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  26.01 
 
 		 1178 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65479  pheromone response pathway  24.31 
 
 		 499 aa  52  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.349403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  28.92 
 
 		 593 aa  51.6  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  27.67 
 
 		 778 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  25.34 
 
 		 835 aa  45.8  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.26 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  22.82 
 
 		 443 aa  45.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.72 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  26.1 
 
 		 717 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.91 
 
 		 818 aa  43.9  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>