53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2795 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  72.35 
 
 		 526 aa  762    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  95.66 
 
 		 576 aa  1135    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  96.35 
 
 		 576 aa  1153    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1190    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  85.93 
 
 		 533 aa  929    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  76.81 
 
 		 524 aa  817    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  33.49 
 
 		 1408 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  31.98 
 
 		 1107 aa  169  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1108 aa  166  9e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  33.07 
 
 		 1410 aa  157  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  33.07 
 
 		 1410 aa  157  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  29.78 
 
 		 1422 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  27.63 
 
 		 480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  30.96 
 
 		 478 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  30.03 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  30.49 
 
 		 480 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  30.56 
 
 		 480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  31.52 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  28.08 
 
 		 480 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  29.32 
 
 		 480 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  28.27 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  28.07 
 
 		 826 aa  108  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  28.95 
 
 		 501 aa  103  7e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  26.72 
 
 		 1222 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.8 
 
 		 921 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  29.07 
 
 		 624 aa  76.6  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  23.91 
 
 		 743 aa  73.9  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  26.44 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.99 
 
 		 593 aa  60.5  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  25.41 
 
 		 363 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  27.22 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  25.33 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  25.61 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  23.77 
 
 		 628 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  25.91 
 
 		 1129 aa  56.2  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  23.95 
 
 		 792 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  26.35 
 
 		 714 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.8 
 
 		 1919 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  25.69 
 
 		 807 aa  51.2  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  27.27 
 
 		 1178 aa  50.4  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  23.64 
 
 		 469 aa  50.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.51 
 
 		 818 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  28.38 
 
 		 900 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  25 
 
 		 555 aa  48.9  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  24.19 
 
 		 461 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  27.05 
 
 		 558 aa  48.5  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.86 
 
 		 706 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.9 
 
 		 837 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  24.59 
 
 		 553 aa  46.2  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  23.87 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06978  RCC1 Chromatin-associated guanine nucleotide exchange factor for Ran (Eurofung)  25.7 
 
 		 533 aa  44.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.359192 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  24.02 
 
 		 1848 aa  43.9  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.1 
 
 		 555 aa  43.5  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>