48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1574 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1018    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  30.87 
 
 		 1408 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.12 
 
 		 1107 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  33.11 
 
 		 1422 aa  124  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 1410 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  31.85 
 
 		 1410 aa  124  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  26 
 
 		 826 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  29.17 
 
 		 480 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  28.41 
 
 		 480 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  28.03 
 
 		 480 aa  107  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  27.79 
 
 		 1108 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  28.78 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  28.79 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  28.95 
 
 		 576 aa  103  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  28.07 
 
 		 576 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  27.62 
 
 		 576 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  28.9 
 
 		 478 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  26.04 
 
 		 480 aa  97.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  26.67 
 
 		 480 aa  97.4  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  28.52 
 
 		 478 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  28.01 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  27.14 
 
 		 524 aa  95.1  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  28.98 
 
 		 1222 aa  90.5  6e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  28.7 
 
 		 526 aa  90.5  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  24.52 
 
 		 743 aa  83.6  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  28.95 
 
 		 624 aa  82.4  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  26.27 
 
 		 593 aa  80.5  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25.83 
 
 		 921 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  26.29 
 
 		 1129 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  27.38 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  27.38 
 
 		 363 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  26.57 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  24.01 
 
 		 911 aa  63.5  0.000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  30.69 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  21.88 
 
 		 1679 aa  58.2  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  26.32 
 
 		 628 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  24.71 
 
 		 1178 aa  53.9  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.17 
 
 		 706 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.16 
 
 		 821 aa  52.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  24.1 
 
 		 778 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.01 
 
 		 469 aa  49.3  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  21.19 
 
 		 818 aa  48.1  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  25.45 
 
 		 835 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  20.51 
 
 		 837 aa  47  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  21.79 
 
 		 1919 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3566  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  22.18 
 
 		 728 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000426417  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1554  hypothetical protein  31.09 
 
 		 618 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0842848  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37043  predicted protein  29.47 
 
 		 643 aa  43.9  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>