41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3769 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  79.58 
 
 		 480 aa  820    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  72.38 
 
 		 478 aa  738    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  96.25 
 
 		 480 aa  962    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  71.34 
 
 		 478 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  71.76 
 
 		 478 aa  729    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  95.83 
 
 		 480 aa  961    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  995    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  95.83 
 
 		 480 aa  958    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  72.48 
 
 		 480 aa  732    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  36.75 
 
 		 1410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  36.75 
 
 		 1410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  35.09 
 
 		 1107 aa  124  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  29.18 
 
 		 526 aa  124  5e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  36.89 
 
 		 1408 aa  123  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  28.42 
 
 		 576 aa  123  9e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  28.23 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  27.16 
 
 		 524 aa  120  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  27.37 
 
 		 576 aa  120  7e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  26.78 
 
 		 576 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  29.17 
 
 		 501 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  32.4 
 
 		 1422 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  30.97 
 
 		 1108 aa  103  8e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  30.13 
 
 		 921 aa  87  7e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  28.87 
 
 		 826 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  27.57 
 
 		 1222 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  27.78 
 
 		 624 aa  77  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  28.57 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  25.91 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  25.91 
 
 		 363 aa  61.6  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  31.35 
 
 		 743 aa  53.9  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.86 
 
 		 555 aa  53.9  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  25 
 
 		 1178 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  26.02 
 
 		 469 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  29.11 
 
 		 1129 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.92 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  26.52 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  27.97 
 
 		 593 aa  45.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  23.88 
 
 		 554 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  24.71 
 
 		 717 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  28.28 
 
 		 443 aa  44.3  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  28.88 
 
 		 681 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>