54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2974 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  95.66 
 
 		 576 aa  1135    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1207  hypothetical protein  85.74 
 
 		 533 aa  932    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3072  hypothetical protein  73.11 
 
 		 526 aa  772    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.80252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  100 
 
 		 576 aa  1193    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  94.44 
 
 		 576 aa  1126    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1401  hypothetical protein  77.57 
 
 		 524 aa  829    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  32.86 
 
 		 1408 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  32.38 
 
 		 1107 aa  167  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  33.07 
 
 		 1410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  33.07 
 
 		 1410 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1108 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1872  putative lipoprotein  30.24 
 
 		 1422 aa  139  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  28.85 
 
 		 478 aa  110  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  27.79 
 
 		 826 aa  107  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  28.68 
 
 		 478 aa  107  9e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  26.04 
 
 		 480 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3177  hypothetical protein  28.66 
 
 		 480 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  27.86 
 
 		 478 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  28.51 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  28.48 
 
 		 480 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  27.62 
 
 		 501 aa  100  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  26.37 
 
 		 480 aa  99  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  25.99 
 
 		 480 aa  93.6  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  26.62 
 
 		 1222 aa  91.7  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  26.59 
 
 		 921 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  31.68 
 
 		 624 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  30.74 
 
 		 593 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  24.94 
 
 		 743 aa  65.1  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  26.82 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  26.07 
 
 		 1129 aa  61.6  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  25.91 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  28.41 
 
 		 714 aa  54.7  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  26.64 
 
 		 1178 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.04 
 
 		 1919 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1555  hypothetical protein  30.34 
 
 		 628 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209089  normal  0.462217 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  25.42 
 
 		 835 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  26.19 
 
 		 818 aa  51.6  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  24.55 
 
 		 469 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  24.91 
 
 		 461 aa  50.8  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  21.21 
 
 		 363 aa  50.4  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  21.21 
 
 		 363 aa  50.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  26.5 
 
 		 558 aa  47.8  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  24.92 
 
 		 807 aa  47.8  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  25.73 
 
 		 837 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  29.35 
 
 		 911 aa  47.4  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  27.92 
 
 		 376 aa  47.4  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.86 
 
 		 706 aa  47  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  26.26 
 
 		 717 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  27.72 
 
 		 900 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  25.49 
 
 		 792 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  24.92 
 
 		 477 aa  44.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_4661  predicted protein  24.42 
 
 		 328 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0235224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  25.68 
 
 		 778 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  23.29 
 
 		 1187 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>