More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1622 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1622  putative hemolysin precursor  100 
 
 		 504 aa  1002    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0615311 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1397  phospholipase/lecithinase/hemolysin-like protein  38.21 
 
 		 538 aa  279  1e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.524599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  44.16 
 
 		 2667 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  55.17 
 
 		 2954 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  43.41 
 
 		 709 aa  87  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.67 
 
 		 1795 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  40.22 
 
 		 2105 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  45.59 
 
 		 795 aa  85.9  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37.14 
 
 		 813 aa  85.5  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  40.14 
 
 		 1156 aa  85.1  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  40.69 
 
 		 867 aa  85.1  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  26.89 
 
 		 4798 aa  84.3  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  43.17 
 
 		 2885 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1227  cadherin domain-containing protein  53.26 
 
 		 2251 aa  83.6  0.000000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.2 
 
 		 3427 aa  83.6  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  40.54 
 
 		 1499 aa  83.2  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  41.21 
 
 		 3091 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  42.52 
 
 		 4106 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.34 
 
 		 1963 aa  82  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  47.32 
 
 		 421 aa  82  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  47.79 
 
 		 260 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  46.09 
 
 		 518 aa  81.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  44.8 
 
 		 585 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  53.19 
 
 		 1424 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  51.85 
 
 		 1236 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  44.8 
 
 		 582 aa  81.3  0.00000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  40.56 
 
 		 606 aa  81.3  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  36.42 
 
 		 491 aa  80.9  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  45.83 
 
 		 1421 aa  80.5  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.83 
 
 		 946 aa  80.5  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.64 
 
 		 3619 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  29.58 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  46.15 
 
 		 679 aa  79.3  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  38.51 
 
 		 938 aa  79.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.86 
 
 		 3619 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  48.15 
 
 		 1164 aa  79  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1997  Hemolysin-type calcium-binding region  46.49 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.177214 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  36.97 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  41.67 
 
 		 942 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.72 
 
 		 2145 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  48.84 
 
 		 3608 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  43.55 
 
 		 1534 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.01 
 
 		 1544 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  50.54 
 
 		 950 aa  78.2  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  38.62 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  41.95 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  41.95 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  52.94 
 
 		 2678 aa  77.4  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.68 
 
 		 1895 aa  77.4  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  43.7 
 
 		 327 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  47.47 
 
 		 5218 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.58 
 
 		 1016 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  39.1 
 
 		 2537 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  49.52 
 
 		 959 aa  76.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  50.94 
 
 		 1197 aa  76.6  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  46.21 
 
 		 4687 aa  77  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  49.52 
 
 		 589 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3766  hemolysin-type calcium-binding protein  60.29 
 
 		 1166 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234003  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 303 aa  76.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.33 
 
 		 588 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  55 
 
 		 980 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  57.75 
 
 		 5962 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  52.38 
 
 		 1383 aa  75.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  52.94 
 
 		 219 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0568  hemolysin-type calcium-binding region  44.09 
 
 		 411 aa  75.9  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.294597  hitchhiker  0.0000308959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2776  hemolysin-type calcium-binding toxin  43.26 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.784877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  38.31 
 
 		 639 aa  75.5  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  37.68 
 
 		 1287 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.18 
 
 		 833 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  47.87 
 
 		 2704 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  42.55 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  44.74 
 
 		 817 aa  75.1  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  50.54 
 
 		 561 aa  74.7  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.76 
 
 		 2775 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0419  hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 1022 aa  74.7  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0424  hemolysin-type calcium-binding region  36.08 
 
 		 1017 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316008  normal  0.221114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  48 
 
 		 686 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  46.15 
 
 		 1814 aa  75.1  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  56.34 
 
 		 9030 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  55.88 
 
 		 1055 aa  74.7  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  43.26 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  43.81 
 
 		 742 aa  74.7  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  60 
 
 		 850 aa  74.3  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  46.39 
 
 		 1346 aa  74.3  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  50.59 
 
 		 1145 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  40.74 
 
 		 7284 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  53.42 
 
 		 1526 aa  73.9  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.55 
 
 		 2346 aa  73.6  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  48.42 
 
 		 5839 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  38.06 
 
 		 982 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  44.63 
 
 		 572 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.98 
 
 		 1712 aa  73.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3199  VCBS  40.87 
 
 		 4854 aa  73.2  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  45.45 
 
 		 744 aa  73.2  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  42.55 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  53.52 
 
 		 8682 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1087  putative outer membrane adhesin like proteiin  53.16 
 
 		 5098 aa  73.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000320164 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  48.68 
 
 		 2296 aa  72.8  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  44.26 
 
 		 1279 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  47.12 
 
 		 2452 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>