More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0102 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  100 
 
 		 1217 aa  2313    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  31.02 
 
 		 2107 aa  439  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  34.69 
 
 		 1156 aa  425  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.5 
 
 		 1499 aa  358  2.9999999999999997e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.8 
 
 		 1789 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  68.87 
 
 		 960 aa  316  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  31.26 
 
 		 1814 aa  310  9e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  31.61 
 
 		 860 aa  299  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.19 
 
 		 2954 aa  270  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  31.61 
 
 		 1607 aa  237  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.71 
 
 		 3598 aa  229  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.03 
 
 		 1480 aa  211  6e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  26.1 
 
 		 3209 aa  209  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  30.16 
 
 		 855 aa  207  9e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.48 
 
 		 2245 aa  204  6e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  27.48 
 
 		 4798 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.06 
 
 		 1925 aa  181  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  28.88 
 
 		 4334 aa  177  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  33.13 
 
 		 1112 aa  174  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  31.14 
 
 		 959 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  28.32 
 
 		 1855 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.13 
 
 		 1400 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  30.38 
 
 		 1421 aa  134  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  29.44 
 
 		 1363 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.25 
 
 		 1279 aa  123  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  27.81 
 
 		 1079 aa  118  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  29.65 
 
 		 692 aa  118  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.77 
 
 		 1145 aa  114  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  28.4 
 
 		 928 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  29.76 
 
 		 3954 aa  112  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.36 
 
 		 1102 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3869  Ca 2+ binding protein  26.35 
 
 		 1572 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.385063  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1306 aa  108  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.9 
 
 		 946 aa  108  7e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.66 
 
 		 4800 aa  107  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  28.09 
 
 		 1895 aa  106  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  29.32 
 
 		 589 aa  103  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  28.15 
 
 		 932 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  28.1 
 
 		 4723 aa  102  6e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  27.69 
 
 		 4687 aa  101  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  35.02 
 
 		 940 aa  101  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  27.86 
 
 		 928 aa  98.2  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  28.68 
 
 		 1286 aa  97.8  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  28.76 
 
 		 1884 aa  97.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  29.32 
 
 		 2911 aa  96.3  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  29.69 
 
 		 1534 aa  95.5  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  27.29 
 
 		 999 aa  95.1  7e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.29 
 
 		 965 aa  93.6  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.24 
 
 		 2689 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  31.87 
 
 		 2105 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  27.71 
 
 		 1582 aa  90.9  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  40.94 
 
 		 1532 aa  90.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.62 
 
 		 1795 aa  89.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  27.59 
 
 		 795 aa  87.4  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.59 
 
 		 518 aa  86.7  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  28.39 
 
 		 942 aa  86.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  47.13 
 
 		 1383 aa  86.7  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31 
 
 		 2775 aa  85.9  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  31.65 
 
 		 3619 aa  85.1  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  26.16 
 
 		 2133 aa  85.1  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.27 
 
 		 2667 aa  85.1  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.63 
 
 		 1884 aa  85.1  0.000000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  27.44 
 
 		 2097 aa  84  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  31.19 
 
 		 3619 aa  81.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  26.81 
 
 		 2836 aa  81.6  0.00000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  28.48 
 
 		 824 aa  80.5  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.89 
 
 		 2678 aa  80.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  33.83 
 
 		 387 aa  79.7  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  33.48 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  33.23 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.17 
 
 		 1415 aa  77  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  27.06 
 
 		 556 aa  77  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0004  hypothetical protein  30.98 
 
 		 414 aa  77  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4306  hemolysin-type calcium-binding region  27.78 
 
 		 682 aa  76.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0651981 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2368  GLUG domain protein  28.4 
 
 		 14829 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  25.78 
 
 		 1628 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.78 
 
 		 2807 aa  75.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.3 
 
 		 2467 aa  75.5  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  32.5 
 
 		 491 aa  75.1  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  30.87 
 
 		 595 aa  74.7  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  29.35 
 
 		 15831 aa  74.3  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  34.83 
 
 		 219 aa  74.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  33.72 
 
 		 844 aa  73.6  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  32.88 
 
 		 742 aa  73.6  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  29.21 
 
 		 516 aa  73.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.1 
 
 		 980 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.08 
 
 		 833 aa  73.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.19 
 
 		 833 aa  70.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  40 
 
 		 3026 aa  70.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  27.61 
 
 		 2198 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01251  hypothetical protein  31.79 
 
 		 531 aa  70.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.430243 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  29.57 
 
 		 1544 aa  69.3  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  33.55 
 
 		 393 aa  68.9  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 		 1287 aa  68.9  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  29.87 
 
 		 1586 aa  68.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  27.38 
 
 		 998 aa  68.6  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  28.57 
 
 		 5769 aa  68.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.61 
 
 		 3427 aa  68.2  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  29.2 
 
 		 3608 aa  67.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1057  putative DNA methylase  26.38 
 
 		 1787 aa  67.8  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>