More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1000 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
844 aa  1697    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  71.97 
 
 
4798 aa  875    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  88.66 
 
 
541 aa  810    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  63.67 
 
 
679 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  58.23 
 
 
585 aa  384  1e-105  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  55.76 
 
 
582 aa  369  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  43.3 
 
 
959 aa  171  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  40.09 
 
 
1112 aa  156  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.66 
 
 
1925 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  34.26 
 
 
940 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  37.67 
 
 
3598 aa  144  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.1 
 
 
1789 aa  143  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  31.11 
 
 
1814 aa  138  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  45.93 
 
 
618 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  38.99 
 
 
1499 aa  134  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  29.7 
 
 
2107 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  32.03 
 
 
1306 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  40.94 
 
 
1809 aa  124  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.33 
 
 
1607 aa  124  9.999999999999999e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  37.26 
 
 
1480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  37.09 
 
 
999 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  37.5 
 
 
428 aa  117  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  36.41 
 
 
928 aa  117  1.0000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  35.92 
 
 
960 aa  110  8.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  43.48 
 
 
466 aa  105  3e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  38.86 
 
 
2954 aa  103  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  36.93 
 
 
1805 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  25.95 
 
 
2296 aa  102  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  37.5 
 
 
1156 aa  100  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  42.31 
 
 
548 aa  97.1  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.94 
 
 
1102 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  32.78 
 
 
4687 aa  92.8  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.1 
 
 
855 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  30.64 
 
 
2245 aa  87  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  41.59 
 
 
320 aa  86.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  38.69 
 
 
2682 aa  86.3  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  41.82 
 
 
677 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  35.94 
 
 
337 aa  84.7  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  41.44 
 
 
532 aa  84.3  0.000000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  30.12 
 
 
2767 aa  82.8  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  42.31 
 
 
364 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  34.59 
 
 
326 aa  82  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.6 
 
 
2689 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.02 
 
 
3209 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  33.33 
 
 
1217 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  36.51 
 
 
3091 aa  74.3  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  35.04 
 
 
359 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  38.17 
 
 
1383 aa  73.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  34.09 
 
 
351 aa  72  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  47.5 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  33.59 
 
 
3026 aa  71.6  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  32.35 
 
 
354 aa  71.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  32.86 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  32.52 
 
 
860 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  29.07 
 
 
5769 aa  68.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  61.4 
 
 
5787 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  29.61 
 
 
788 aa  67  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  48.75 
 
 
1502 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  34.62 
 
 
371 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.54 
 
 
1279 aa  65.9  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  47.37 
 
 
622 aa  65.5  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  33.81 
 
 
1534 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  35.58 
 
 
345 aa  64.7  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  31.18 
 
 
346 aa  64.7  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  51.16 
 
 
161 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  28.48 
 
 
755 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2509  Hemolysin-type calcium binding domain protein  38.46 
 
 
352 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.70233  normal  0.227356 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.2 
 
 
9867 aa  62.4  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2371  hypothetical protein  36.46 
 
 
510 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3591  putative outer membrane adhesin like proteiin  59.18 
 
 
4220 aa  62  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  29.68 
 
 
1544 aa  61.6  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  35.9 
 
 
686 aa  61.6  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.48 
 
 
5962 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.5 
 
 
946 aa  60.8  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.33 
 
 
2911 aa  60.5  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  32.43 
 
 
2105 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  57.14 
 
 
4791 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 
615 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  26.09 
 
 
351 aa  60.1  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.66 
 
 
2678 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  32.2 
 
 
1197 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  30.77 
 
 
327 aa  58.9  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  32.48 
 
 
1532 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  27.08 
 
 
2113 aa  59.3  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.13 
 
 
3954 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  44.3 
 
 
5218 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  31.71 
 
 
295 aa  58.5  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  47.69 
 
 
491 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  34.26 
 
 
435 aa  58.2  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.16 
 
 
820 aa  58.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.58 
 
 
980 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  32.69 
 
 
422 aa  57.8  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1201  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  33.77 
 
 
377 aa  57.8  0.0000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  42.5 
 
 
2537 aa  57.4  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.57 
 
 
1180 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  43.66 
 
 
6662 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  44.59 
 
 
16322 aa  56.6  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  43.66 
 
 
6779 aa  57  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.4 
 
 
1079 aa  56.6  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  43.04 
 
 
2542 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>