60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1191 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  100 
 
 
428 aa  845    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  94.02 
 
 
548 aa  617  1e-175  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  48.68 
 
 
928 aa  342  8e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  51.13 
 
 
466 aa  306  6e-82  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  54.32 
 
 
532 aa  298  2e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  44.53 
 
 
618 aa  277  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  43.91 
 
 
677 aa  218  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  65.42 
 
 
320 aa  134  3e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  34.53 
 
 
844 aa  120  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  34.7 
 
 
959 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.86 
 
 
1925 aa  117  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  36.49 
 
 
940 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.04 
 
 
1789 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  37.68 
 
 
4798 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  35.62 
 
 
1814 aa  113  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  36.54 
 
 
541 aa  112  9e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  36.71 
 
 
679 aa  110  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.65 
 
 
2107 aa  110  6e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.94 
 
 
3598 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  35.85 
 
 
1306 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.63 
 
 
1499 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  30.99 
 
 
1112 aa  97.8  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  32.75 
 
 
1809 aa  97.8  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  34.87 
 
 
1607 aa  96.7  8e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31.19 
 
 
4687 aa  96.3  9e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  40.91 
 
 
582 aa  94.7  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  33.33 
 
 
326 aa  94.4  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  35.5 
 
 
999 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  34.76 
 
 
1480 aa  88.6  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  36.31 
 
 
585 aa  84.7  0.000000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1201  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  37.32 
 
 
377 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.12617  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  36.3 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  37.96 
 
 
2296 aa  74.3  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  33.56 
 
 
960 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  44.94 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  26.42 
 
 
354 aa  70.9  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  34.53 
 
 
1805 aa  70.1  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 
1544 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  33.33 
 
 
788 aa  68.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  31.25 
 
 
2767 aa  65.9  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0591  hypothetical protein  53.23 
 
 
93 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.813935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0588  hypothetical protein  53.23 
 
 
93 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.26826  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  34.07 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  35.65 
 
 
364 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  32.77 
 
 
371 aa  64.7  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  37.04 
 
 
345 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  29.48 
 
 
346 aa  63.2  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  31.2 
 
 
359 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  36.84 
 
 
3209 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  34.21 
 
 
351 aa  62  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  30.19 
 
 
351 aa  62.4  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  36.36 
 
 
422 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  32.5 
 
 
327 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  31.68 
 
 
295 aa  56.6  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  27.68 
 
 
435 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  43.08 
 
 
265 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  27.86 
 
 
755 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  28.7 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0589  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  63.89 
 
 
288 aa  47  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  29.68 
 
 
2911 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>