54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0927 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  47.67 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  43.13 
 
 		 371 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  43.84 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  44.94 
 
 		 351 aa  295  1e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  49.45 
 
 		 354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  39.89 
 
 		 345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  39.22 
 
 		 346 aa  245  9e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  46.69 
 
 		 327 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  36.03 
 
 		 422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  40.89 
 
 		 435 aa  172  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  32.21 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  36.88 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  38.68 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  34.03 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  45.24 
 
 		 1925 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  36.96 
 
 		 940 aa  83.2  0.000000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  35.92 
 
 		 585 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  36.96 
 
 		 1789 aa  80.9  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  35.86 
 
 		 959 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  33.71 
 
 		 1809 aa  80.9  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  34.31 
 
 		 4798 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  35.29 
 
 		 679 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  34.59 
 
 		 1112 aa  75.5  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  36.89 
 
 		 1499 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  32.52 
 
 		 466 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  31.98 
 
 		 3598 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  32.58 
 
 		 4687 aa  72  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  34.09 
 
 		 844 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  32.39 
 
 		 582 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  32.35 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  32.85 
 
 		 928 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1306 aa  70.1  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  34.42 
 
 		 960 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  31.37 
 
 		 1814 aa  68.9  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  34.45 
 
 		 1480 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  34.45 
 
 		 999 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.16 
 
 		 2107 aa  66.6  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  32.41 
 
 		 677 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  37.76 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  27.43 
 
 		 532 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  32.45 
 
 		 1607 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  33.65 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  30.26 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  30.33 
 
 		 548 aa  59.3  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  29.75 
 
 		 1805 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  43.08 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  27.78 
 
 		 2682 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  26.53 
 
 		 618 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.1 
 
 		 3209 aa  51.2  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  24.91 
 
 		 1544 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  26.75 
 
 		 2296 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  30.65 
 
 		 755 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  27.2 
 
 		 2113 aa  43.5  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>