218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2371 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2371  hypothetical protein  100 
 
 
510 aa  1029    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.17 
 
 
2689 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  25.41 
 
 
1383 aa  81.6  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  27.64 
 
 
928 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  35.36 
 
 
844 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  33.77 
 
 
5769 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0959  hypothetical protein  34.45 
 
 
1079 aa  59.3  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.36897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  51.56 
 
 
4798 aa  58.9  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  55.32 
 
 
2796 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3521  hypothetical protein  52.54 
 
 
161 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0357588  normal  0.598556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  42.47 
 
 
4687 aa  57.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  44.32 
 
 
2954 aa  57  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.1 
 
 
3427 aa  57  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  46.15 
 
 
3091 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  58 
 
 
959 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  40.4 
 
 
3598 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  24.36 
 
 
855 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4608  Hemolysin-type calcium-binding region  49.12 
 
 
491 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.912572 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  47.46 
 
 
1499 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  58 
 
 
860 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  54.9 
 
 
1102 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  44.44 
 
 
4678 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03672  putative hemolysin-type calcium-binding protein  42.86 
 
 
589 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0340906 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1115  hypothetical protein  23.93 
 
 
500 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.506809  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  45.71 
 
 
2245 aa  52.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  41.27 
 
 
1394 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  47.46 
 
 
999 aa  52.4  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1952  triacylglycerol lipase  37.8 
 
 
622 aa  52.4  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3665  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.43 
 
 
1052 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.27613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  47.46 
 
 
2704 aa  51.6  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  40.45 
 
 
851 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  47.46 
 
 
540 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.46 
 
 
3954 aa  51.2  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  37.23 
 
 
585 aa  51.6  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  36.71 
 
 
9867 aa  51.6  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0436  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.55 
 
 
5787 aa  51.2  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3592  Hemolysin-type calcium-binding region  42.62 
 
 
303 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0868117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1100  hemolysin-type calcium-binding region  53.33 
 
 
2345 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.400206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  40.26 
 
 
534 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4126  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 
497 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.560509  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4494  Hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 
497 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.486287  normal  0.131139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  42.62 
 
 
2667 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2993  Hemolysin-type calcium-binding region  42.65 
 
 
507 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1170  methyltransferase small  27.74 
 
 
1197 aa  50.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0681  structural toxin protein RtxA  32.5 
 
 
7919 aa  50.4  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  47.46 
 
 
546 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1117  hypothetical protein  28.76 
 
 
163 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.152735  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  34.83 
 
 
4848 aa  50.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 
1895 aa  49.7  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  45.59 
 
 
2885 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  39.51 
 
 
744 aa  50.1  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  36.17 
 
 
679 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  47.46 
 
 
589 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  41.1 
 
 
2542 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  46.15 
 
 
3209 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0379  VCBS  50.85 
 
 
7284 aa  48.9  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.943155 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  43.28 
 
 
998 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  51.92 
 
 
1480 aa  49.3  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1161  Hemolysin-type calcium-binding region  42.19 
 
 
2537 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  42.25 
 
 
1156 aa  48.5  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  30.06 
 
 
7679 aa  48.5  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  38.16 
 
 
1814 aa  48.5  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0589  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  44.07 
 
 
288 aa  48.5  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  49.15 
 
 
1306 aa  48.5  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  36.26 
 
 
582 aa  48.5  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  42.11 
 
 
4791 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2323  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
704 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  48.21 
 
 
2178 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2342  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.86 
 
 
2812 aa  48.5  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000136287 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  44.07 
 
 
540 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  48.21 
 
 
1650 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.24 
 
 
1884 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.04 
 
 
1073 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  50 
 
 
574 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0006  von Willebrand factor type A  45.76 
 
 
2452 aa  47.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4609  Hemolysin-type calcium-binding region  53.49 
 
 
480 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  40.28 
 
 
5218 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  43.64 
 
 
1557 aa  47.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  37.63 
 
 
1424 aa  47.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 
5962 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.59 
 
 
219 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  42.86 
 
 
782 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4079  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  45.16 
 
 
485 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.237943  normal  0.0279439 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  39.51 
 
 
1112 aa  47.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 
620 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4495  Hemolysin-type calcium-binding region  47.27 
 
 
475 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.970189  normal  0.186376 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  43.84 
 
 
1363 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  47.62 
 
 
742 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.82 
 
 
1795 aa  47.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  37.93 
 
 
417 aa  47  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  38.96 
 
 
2775 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  44.23 
 
 
1502 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  44.44 
 
 
2911 aa  47.4  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  40.58 
 
 
1534 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  41.18 
 
 
16322 aa  47  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  43.08 
 
 
1145 aa  47  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  33.68 
 
 
559 aa  47  0.0009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  49.21 
 
 
767 aa  47  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  42.03 
 
 
1625 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0729  hemolysin-type calcium-binding region  48 
 
 
7072 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.971517 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>