59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1572 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  100 
 
 		 435 aa  887    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  65.34 
 
 		 2107 aa  561  1.0000000000000001e-159  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  76.6 
 
 		 1814 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  71.9 
 
 		 940 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  63.83 
 
 		 1607 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  79.25 
 
 		 1789 aa  171  3e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  71.08 
 
 		 1480 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  71.08 
 
 		 999 aa  121  3e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  70.59 
 
 		 1499 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1510  hypothetical protein  71.62 
 
 		 90 aa  103  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.722209  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1506  hypothetical protein  72.97 
 
 		 90 aa  103  8e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  56.32 
 
 		 3598 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1570  hypothetical protein  71.62 
 
 		 95 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.685992  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1504  hypothetical protein  69.86 
 
 		 89 aa  95.9  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.602515  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1502  hypothetical protein  70.42 
 
 		 90 aa  94.7  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.183006  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  66.18 
 
 		 265 aa  91.7  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  51.09 
 
 		 959 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1508  hypothetical protein  64.86 
 
 		 90 aa  87.4  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616664  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  50.6 
 
 		 1112 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  48.1 
 
 		 1809 aa  78.2  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  44.9 
 
 		 541 aa  77  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  43.02 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  48.15 
 
 		 4798 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  49.38 
 
 		 679 aa  74.7  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  49.38 
 
 		 585 aa  73.9  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  43.53 
 
 		 677 aa  73.6  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  43.53 
 
 		 928 aa  73.6  0.000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  47.5 
 
 		 844 aa  72  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  45.35 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  43.53 
 
 		 532 aa  70.9  0.00000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  41.86 
 
 		 466 aa  70.5  0.00000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  45.35 
 
 		 548 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  48.15 
 
 		 582 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  60 
 
 		 4687 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  47.5 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  42.35 
 
 		 320 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  29.47 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  46.15 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  43.08 
 
 		 351 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  43.08 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  44.87 
 
 		 346 aa  57  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  37.5 
 
 		 371 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  46.15 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  41.67 
 
 		 1925 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  39.64 
 
 		 960 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  54.9 
 
 		 1544 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  48.15 
 
 		 2682 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  49.23 
 
 		 351 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  37.97 
 
 		 364 aa  50.4  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  37.97 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  41.54 
 
 		 345 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  41.27 
 
 		 2296 aa  47.4  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  36.36 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  34.58 
 
 		 1306 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  39.68 
 
 		 3209 aa  47.4  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  35.29 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  38.81 
 
 		 359 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  40.98 
 
 		 1805 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  32.39 
 
 		 2911 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>